59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5363 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5363  CHRD domain containing protein  100 
 
 		 282 aa  588  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.974056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4549  CHRD domain-containing protein  33.92 
 
 		 862 aa  141  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  31.89 
 
 		 819 aa  95.9  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3444  CHRD domain containing protein  41.74 
 
 		 147 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576852  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1308  CHRD  39.83 
 
 		 140 aa  84  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.971052  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0551  CHRD domain-containing protein  38.14 
 
 		 144 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6737  CHRD domain-containing protein  40.87 
 
 		 147 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2798  CHRD domain-containing protein  38.98 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.885551  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2665  CHRD domain-containing protein  38.98 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2226  CHRD  37.72 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.156145  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0581  CHRD domain-containing protein  28.97 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2824  CHRD domain-containing protein  27.82 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.227844  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6077  CHRD domain-containing protein  36.44 
 
 		 144 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.563536 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2748  CHRD domain-containing protein  33.78 
 
 		 144 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2136  CHRD domain-containing protein  33.78 
 
 		 144 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.911321  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2774  CHRD domain-containing protein  33.78 
 
 		 144 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3001  chordin  36.44 
 
 		 171 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1080  CHRD  37.72 
 
 		 141 aa  77  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.183824 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3145  CHRD  29.6 
 
 		 413 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0538  CHRD domain-containing superfamily  33.55 
 
 		 144 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0170  hypothetical protein  36.36 
 
 		 134 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2381  CHRD domain-containing protein  36.36 
 
 		 144 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.740751  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0666  CHRD domain-containing protein  36.36 
 
 		 144 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2778  CHRD domain-containing protein  36.36 
 
 		 144 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2301  CHRD domain-containing protein  36.36 
 
 		 144 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.712267  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0650  CHRD domain-containing protein  36.36 
 
 		 144 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.644603  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0826  hypothetical protein  36.36 
 
 		 144 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3258  CHRD domain containing protein  30.31 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335818  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0634  CHRD domain containing protein  35.59 
 
 		 144 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.231612  normal  0.156078 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3336  CHRD domain containing protein  29.25 
 
 		 412 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1896  CHRD domain-containing protein  37.29 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0359  CHRD domain-containing protein  32.48 
 
 		 144 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4065  hypothetical protein  34.75 
 
 		 144 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  29.18 
 
 		 479 aa  65.1  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2966  hypothetical protein  35 
 
 		 173 aa  65.1  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0444  CHRD domain-containing protein  35.29 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2218  CHRD domain containing protein  33.9 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2082  hypothetical protein  29.63 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  25 
 
 		 652 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2026  CHRD domain containing protein  29.73 
 
 		 151 aa  57  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0019  hypothetical protein  31.3 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.229007  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0022  hypothetical protein  31.3 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0352588  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3037  CHRD domain-containing protein  34.51 
 
 		 170 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2332  hypothetical protein  29.69 
 
 		 132 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2174  hypothetical protein  29.69 
 
 		 132 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.324144  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2111  hypothetical protein  29.69 
 
 		 132 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000509964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2354  hypothetical protein  29.69 
 
 		 132 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5666  CHRD domain containing protein  28.4 
 
 		 161 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2427  hypothetical protein  29.69 
 
 		 132 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1174  CHRD domain containing protein  28.7 
 
 		 140 aa  49.7  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0629286  normal  0.936237 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1716  CHRD  37.7 
 
 		 145 aa  50.1  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.344065  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0158  hypothetical protein  35.65 
 
 		 513 aa  48.5  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2096  hypothetical protein  28.91 
 
 		 132 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0541  CHRD domain containing protein  23.74 
 
 		 137 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.9695  normal  0.973428 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37354  predicted protein  30.7 
 
 		 150 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0263858  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2087  CHRD domain containing protein  33.09 
 
 		 729 aa  46.6  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.090076 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3954  CHRD domain containing protein  33.05 
 
 		 145 aa  46.2  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.689351  normal  0.0638434 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0849  hypothetical protein  27.56 
 
 		 213 aa  45.8  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.873186 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0338  CHRD domain containing protein  28.8 
 
 		 154 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>