45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2087 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2087  CHRD domain containing protein  100 
 
 		 729 aa  1388    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.090076 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4098  hypothetical protein  31.2 
 
 		 1064 aa  117  7.999999999999999e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0884  hypothetical protein  32.41 
 
 		 1578 aa  112  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0424461  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2471  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  32.54 
 
 		 1489 aa  95.1  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3913  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  32.06 
 
 		 1710 aa  94  9e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806199  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2734  hypothetical protein  34.36 
 
 		 1374 aa  84.7  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2866  GLUG domain protein  24.19 
 
 		 2267 aa  78.6  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2141  hypothetical protein  26.04 
 
 		 1165 aa  77.4  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.515545  normal  0.041224 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2263  hypothetical protein  25.38 
 
 		 914 aa  76.6  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0299085  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3088  hypothetical protein  41.84 
 
 		 233 aa  75.1  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2857  hypothetical protein  30.39 
 
 		 920 aa  69.7  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548236  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1194  hypothetical protein  40.78 
 
 		 531 aa  66.6  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1628  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.95 
 
 		 1215 aa  65.9  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.279329 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2795  hypothetical protein  37.35 
 
 		 961 aa  65.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.827572  hitchhiker  0.0000678695 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3954  CHRD domain containing protein  46.99 
 
 		 145 aa  63.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.689351  normal  0.0638434 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1817  hypothetical protein  41.86 
 
 		 486 aa  61.6  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3145  CHRD  29.81 
 
 		 413 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2314  Protein of unknown function DUF1628  31.01 
 
 		 527 aa  54.7  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.561661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2427  hypothetical protein  40.83 
 
 		 132 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2111  hypothetical protein  39.02 
 
 		 132 aa  53.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000509964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2332  hypothetical protein  39.02 
 
 		 132 aa  53.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2174  hypothetical protein  39.02 
 
 		 132 aa  53.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.324144  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2354  hypothetical protein  39.02 
 
 		 132 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2043  XGLTT repeat protein  31.63 
 
 		 437 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2113  Repeat of unknown function XGLTT  39.67 
 
 		 462 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2096  hypothetical protein  39.02 
 
 		 132 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5937  ABC transporter related  40 
 
 		 765 aa  52.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268315  normal  0.587315 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1869  hypothetical protein  33.59 
 
 		 421 aa  52  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5172  hypothetical protein  32.97 
 
 		 735 aa  51.6  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  35.29 
 
 		 819 aa  51.2  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3722  hypothetical protein  28.34 
 
 		 895 aa  51.2  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265869  normal  0.601443 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  26.92 
 
 		 1023 aa  51.2  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71553  predicted protein  32.5 
 
 		 4979 aa  50.4  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.473575 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  39.08 
 
 		 479 aa  50.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3744  hypothetical protein  29.53 
 
 		 416 aa  48.9  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0211  hypothetical protein  25.45 
 
 		 741 aa  48.5  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.552995  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2054  CHRD domain-containing protein  29.56 
 
 		 139 aa  47.8  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.332284  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3336  CHRD domain containing protein  27.95 
 
 		 412 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  34.74 
 
 		 652 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5363  CHRD domain containing protein  32.33 
 
 		 282 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.974056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0991  superfamily I DNA/RNA helicase  31.01 
 
 		 2622 aa  46.6  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3258  CHRD domain containing protein  27.33 
 
 		 411 aa  45.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335818  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0052  hypothetical protein  29.37 
 
 		 377 aa  45.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0158  hypothetical protein  30.95 
 
 		 513 aa  43.9  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  25.13 
 
 		 966 aa  43.9  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>