64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2824 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2824  CHRD domain-containing protein  100 
 
 
407 aa  807    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.227844  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  33.33 
 
 
479 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4516  putative esterase  50.38 
 
 
422 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  33.46 
 
 
819 aa  99.4  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1996  hypothetical protein  43.08 
 
 
900 aa  92.8  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17629  normal  0.339226 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  45 
 
 
2003 aa  86.3  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1999  immunoglobulin I-set domain-containing protein  42.47 
 
 
1362 aa  85.9  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354516  normal  0.677634 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3988  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  40 
 
 
601 aa  84  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5363  CHRD domain containing protein  28.92 
 
 
282 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.974056  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3258  CHRD domain containing protein  30.52 
 
 
411 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335818  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4532  hypothetical protein  41.48 
 
 
774 aa  80.5  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3145  CHRD  31.28 
 
 
413 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4549  CHRD domain-containing protein  25.45 
 
 
862 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0581  CHRD domain-containing protein  29.75 
 
 
408 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3336  CHRD domain containing protein  30.65 
 
 
412 aa  76.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  34.78 
 
 
963 aa  69.7  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2774  CHRD domain-containing protein  31.33 
 
 
144 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3037  CHRD domain-containing protein  36.43 
 
 
170 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2136  CHRD domain-containing protein  31.33 
 
 
144 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.911321  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2748  CHRD domain-containing protein  31.33 
 
 
144 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2518  hypothetical protein  35.37 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.744051 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  37.59 
 
 
1991 aa  68.2  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1080  CHRD  37.5 
 
 
141 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.183824 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1308  CHRD  36.97 
 
 
140 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.971052  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6077  CHRD domain-containing protein  31.33 
 
 
144 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.563536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3444  CHRD domain containing protein  35.59 
 
 
147 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576852  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0551  CHRD domain-containing protein  32 
 
 
144 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2665  CHRD domain-containing protein  31.2 
 
 
144 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2798  CHRD domain-containing protein  31.2 
 
 
144 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.885551  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0801  hypothetical protein  35.29 
 
 
260 aa  60.1  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0158  hypothetical protein  33.91 
 
 
513 aa  59.3  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6737  CHRD domain-containing protein  34.75 
 
 
147 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0359  CHRD domain-containing protein  30.95 
 
 
144 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0538  CHRD domain-containing superfamily  34.92 
 
 
144 aa  57  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2578  hypothetical protein  29.03 
 
 
201 aa  55.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0170  hypothetical protein  34.13 
 
 
134 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2381  CHRD domain-containing protein  32 
 
 
144 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.740751  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2301  CHRD domain-containing protein  32 
 
 
144 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.712267  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2778  CHRD domain-containing protein  32 
 
 
144 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0826  hypothetical protein  34.13 
 
 
144 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4065  hypothetical protein  31.71 
 
 
144 aa  54.3  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435271  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0666  CHRD domain-containing protein  32 
 
 
144 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0650  CHRD domain-containing protein  32 
 
 
144 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.644603  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  25.22 
 
 
652 aa  53.9  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3001  chordin  30.15 
 
 
171 aa  53.5  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0634  CHRD domain containing protein  30.95 
 
 
144 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.231612  normal  0.156078 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2066  hypothetical protein  36.71 
 
 
150 aa  51.6  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3954  CHRD domain containing protein  34.71 
 
 
145 aa  51.2  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.689351  normal  0.0638434 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1896  CHRD domain-containing protein  29.6 
 
 
156 aa  50.8  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2082  hypothetical protein  31.51 
 
 
199 aa  50.1  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114643  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2966  hypothetical protein  30.3 
 
 
173 aa  48.9  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2218  CHRD domain containing protein  32.2 
 
 
149 aa  47.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1716  CHRD  34.17 
 
 
145 aa  47  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.344065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2111  hypothetical protein  30 
 
 
132 aa  46.6  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000509964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2354  hypothetical protein  30 
 
 
132 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2332  hypothetical protein  30 
 
 
132 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2174  hypothetical protein  30 
 
 
132 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.324144  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2096  hypothetical protein  30 
 
 
132 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37354  predicted protein  30.08 
 
 
150 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0263858  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2427  hypothetical protein  29.23 
 
 
132 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1194  hypothetical protein  28.91 
 
 
531 aa  44.3  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0022  hypothetical protein  24.66 
 
 
144 aa  44.3  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0352588  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0444  CHRD domain-containing protein  29.92 
 
 
151 aa  43.9  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182512  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1174  CHRD domain containing protein  30.84 
 
 
140 aa  43.1  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0629286  normal  0.936237 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>