71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2798 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2798  CHRD domain-containing protein  100 
 
 		 144 aa  293  7e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.885551  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2665  CHRD domain-containing protein  99.31 
 
 		 144 aa  291  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6077  CHRD domain-containing protein  90.28 
 
 		 144 aa  268  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.563536 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2748  CHRD domain-containing protein  88.89 
 
 		 144 aa  265  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2136  CHRD domain-containing protein  88.89 
 
 		 144 aa  265  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.911321  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2774  CHRD domain-containing protein  88.89 
 
 		 144 aa  265  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0551  CHRD domain-containing protein  82.64 
 
 		 144 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0538  CHRD domain-containing superfamily  76.39 
 
 		 144 aa  224  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2381  CHRD domain-containing protein  73.61 
 
 		 144 aa  216  7e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.740751  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2778  CHRD domain-containing protein  73.61 
 
 		 144 aa  216  7e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2301  CHRD domain-containing protein  73.61 
 
 		 144 aa  216  7e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.712267  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0666  CHRD domain-containing protein  72.92 
 
 		 144 aa  215  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0826  hypothetical protein  73.61 
 
 		 144 aa  216  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0650  CHRD domain-containing protein  72.92 
 
 		 144 aa  215  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.644603  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0170  hypothetical protein  76.12 
 
 		 134 aa  210  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0359  CHRD domain-containing protein  61.11 
 
 		 144 aa  189  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4065  hypothetical protein  61.81 
 
 		 144 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0634  CHRD domain containing protein  62.5 
 
 		 144 aa  187  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.231612  normal  0.156078 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1080  CHRD  56.62 
 
 		 141 aa  144  5e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.183824 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1308  CHRD  54.61 
 
 		 140 aa  142  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.971052  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6737  CHRD domain-containing protein  49.31 
 
 		 147 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3444  CHRD domain containing protein  56.41 
 
 		 147 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576852  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3001  chordin  46.22 
 
 		 171 aa  123  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_004310  BR0022  hypothetical protein  44.29 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0352588  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0019  hypothetical protein  43.57 
 
 		 144 aa  116  9e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.229007  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2226  CHRD  46.22 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.156145  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1896  CHRD domain-containing protein  47.73 
 
 		 156 aa  112  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0444  CHRD domain-containing protein  51.09 
 
 		 151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2218  CHRD domain containing protein  48.25 
 
 		 149 aa  110  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2966  hypothetical protein  41.13 
 
 		 173 aa  100  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2480  CHRD domain-containing protein  41.43 
 
 		 148 aa  94.4  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0119714  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4549  CHRD domain-containing protein  38.33 
 
 		 862 aa  90.9  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1174  CHRD domain containing protein  42.37 
 
 		 140 aa  87.4  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0629286  normal  0.936237 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5363  CHRD domain containing protein  38.98 
 
 		 282 aa  80.1  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.974056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2082  hypothetical protein  37.62 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5666  CHRD domain containing protein  29.94 
 
 		 161 aa  72  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3037  CHRD domain-containing protein  35.9 
 
 		 170 aa  67  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  35.34 
 
 		 479 aa  63.9  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2054  CHRD domain-containing protein  40.44 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.332284  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0158  hypothetical protein  34.86 
 
 		 513 aa  60.1  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0581  CHRD domain-containing protein  38.46 
 
 		 408 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2824  CHRD domain-containing protein  29.63 
 
 		 407 aa  57.4  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.227844  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1716  CHRD  37.5 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.344065  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0849  hypothetical protein  32.21 
 
 		 213 aa  57  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.873186 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3258  CHRD domain containing protein  39.32 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335818  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2026  CHRD domain containing protein  31.9 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3336  CHRD domain containing protein  38.46 
 
 		 412 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37354  predicted protein  34.15 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0263858  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  29.63 
 
 		 819 aa  53.5  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3145  CHRD  39.32 
 
 		 413 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1290  CHRD  30.49 
 
 		 206 aa  52.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.200605  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2578  hypothetical protein  26.51 
 
 		 201 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2066  hypothetical protein  32.37 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2332  hypothetical protein  26.92 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2427  hypothetical protein  31.3 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2174  hypothetical protein  26.92 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.324144  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2111  hypothetical protein  26.92 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000509964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2354  hypothetical protein  26.92 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2096  hypothetical protein  26.36 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0541  CHRD domain containing protein  25.42 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.9695  normal  0.973428 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4998  CHRD domain-containing protein  25.37 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  34.33 
 
 		 652 aa  44.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  30.92 
 
 		 460 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0338  CHRD domain containing protein  31.16 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5294  hypothetical protein  24.63 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000867603 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5053  hypothetical protein  24.63 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5438  hypothetical protein  24.63 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4883  hypothetical protein  24.63 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5634  hypothetical protein  25.37 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.946842  hitchhiker  0.0000000000653167 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5325  hypothetical protein  25.37 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5370  hypothetical protein  23.13 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.847309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>