36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1290 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1290  CHRD  100 
 
 
206 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.200605  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0849  hypothetical protein  46.67 
 
 
213 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.873186 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2578  hypothetical protein  53.85 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2082  hypothetical protein  32.24 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114643  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6737  CHRD domain-containing protein  30.41 
 
 
147 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4549  CHRD domain-containing protein  32.39 
 
 
862 aa  54.7  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3444  CHRD domain containing protein  30.95 
 
 
147 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576852  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3037  CHRD domain-containing protein  31.65 
 
 
170 aa  53.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2748  CHRD domain-containing protein  31.71 
 
 
144 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2774  CHRD domain-containing protein  31.71 
 
 
144 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2136  CHRD domain-containing protein  31.71 
 
 
144 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.911321  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0666  CHRD domain-containing protein  31.25 
 
 
144 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0650  CHRD domain-containing protein  31.25 
 
 
144 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.644603  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2301  CHRD domain-containing protein  31.25 
 
 
144 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.712267  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2778  CHRD domain-containing protein  31.25 
 
 
144 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2381  CHRD domain-containing protein  31.25 
 
 
144 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.740751  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0826  hypothetical protein  31.25 
 
 
144 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6077  CHRD domain-containing protein  30.49 
 
 
144 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.563536 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0538  CHRD domain-containing superfamily  31.06 
 
 
144 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0170  hypothetical protein  31.01 
 
 
134 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1080  CHRD  32.05 
 
 
141 aa  48.5  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.183824 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0359  CHRD domain-containing protein  30.38 
 
 
144 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0022  hypothetical protein  26.71 
 
 
144 aa  46.6  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0352588  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2966  hypothetical protein  30.54 
 
 
173 aa  46.6  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1308  CHRD  30.86 
 
 
140 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.971052  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2798  CHRD domain-containing protein  28.87 
 
 
144 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.885551  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2665  CHRD domain-containing protein  28.87 
 
 
144 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1750  hypothetical protein  29.82 
 
 
315 aa  46.6  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.489319  normal  0.427262 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3461  CHRD domain containing protein  28.65 
 
 
211 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.664498 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0019  hypothetical protein  26.09 
 
 
144 aa  45.1  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.229007  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0551  CHRD domain-containing protein  29.58 
 
 
144 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3001  chordin  29.79 
 
 
171 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4065  hypothetical protein  28.93 
 
 
144 aa  43.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435271  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1896  CHRD domain-containing protein  32.62 
 
 
156 aa  42.7  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0634  CHRD domain containing protein  28.93 
 
 
144 aa  42.4  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.231612  normal  0.156078 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2026  CHRD domain containing protein  28.78 
 
 
151 aa  42.4  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>