40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0849 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0849  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  427  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.873186 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1290  CHRD  49.72 
 
 		 206 aa  144  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.200605  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2578  hypothetical protein  52.53 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6737  CHRD domain-containing protein  37.67 
 
 		 147 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2966  hypothetical protein  33.16 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2082  hypothetical protein  33.64 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3444  CHRD domain containing protein  35.1 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576852  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1080  CHRD  33.54 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.183824 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0551  CHRD domain-containing protein  33.09 
 
 		 144 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0826  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2381  CHRD domain-containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.740751  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0666  CHRD domain-containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0170  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0650  CHRD domain-containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.644603  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2301  CHRD domain-containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.712267  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2778  CHRD domain-containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1308  CHRD  35.71 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.971052  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0538  CHRD domain-containing superfamily  33.33 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0444  CHRD domain-containing protein  34.73 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6077  CHRD domain-containing protein  31.76 
 
 		 144 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.563536 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2798  CHRD domain-containing protein  32.37 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.885551  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0022  hypothetical protein  31.07 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0352588  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2665  CHRD domain-containing protein  32.86 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0019  hypothetical protein  30.51 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.229007  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3037  CHRD domain-containing protein  30.72 
 
 		 170 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4549  CHRD domain-containing protein  33.12 
 
 		 862 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2748  CHRD domain-containing protein  32 
 
 		 144 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2136  CHRD domain-containing protein  32 
 
 		 144 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.911321  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0359  CHRD domain-containing protein  28.57 
 
 		 144 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2774  CHRD domain-containing protein  32 
 
 		 144 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1896  CHRD domain-containing protein  33.11 
 
 		 156 aa  49.7  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4065  hypothetical protein  30.2 
 
 		 144 aa  49.7  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0634  CHRD domain containing protein  27.52 
 
 		 144 aa  48.5  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.231612  normal  0.156078 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2226  CHRD  30.67 
 
 		 152 aa  48.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.156145  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  27.95 
 
 		 819 aa  46.6  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5363  CHRD domain containing protein  30.13 
 
 		 282 aa  46.2  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.974056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3001  chordin  29.25 
 
 		 171 aa  45.4  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0211  hypothetical protein  63.33 
 
 		 248 aa  44.3  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.180901 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0581  CHRD domain-containing protein  31.65 
 
 		 408 aa  41.6  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2005  hypothetical protein  32.89 
 
 		 148 aa  41.6  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00997836  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>