70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4065 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4065  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  295  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435271  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0634  CHRD domain containing protein  96.53 
 
 
144 aa  285  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.231612  normal  0.156078 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0359  CHRD domain-containing protein  82.64 
 
 
144 aa  254  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0650  CHRD domain-containing protein  65.97 
 
 
144 aa  201  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.644603  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0666  CHRD domain-containing protein  65.97 
 
 
144 aa  201  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2778  CHRD domain-containing protein  65.97 
 
 
144 aa  201  4e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2301  CHRD domain-containing protein  65.97 
 
 
144 aa  201  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.712267  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2381  CHRD domain-containing protein  65.97 
 
 
144 aa  201  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.740751  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2136  CHRD domain-containing protein  66.67 
 
 
144 aa  200  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.911321  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2748  CHRD domain-containing protein  66.67 
 
 
144 aa  200  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2774  CHRD domain-containing protein  66.67 
 
 
144 aa  200  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0826  hypothetical protein  65.97 
 
 
144 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0538  CHRD domain-containing superfamily  65.97 
 
 
144 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6077  CHRD domain-containing protein  64.58 
 
 
144 aa  192  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.563536 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0170  hypothetical protein  67.91 
 
 
134 aa  190  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0551  CHRD domain-containing protein  65.97 
 
 
144 aa  189  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2665  CHRD domain-containing protein  61.81 
 
 
144 aa  179  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2798  CHRD domain-containing protein  66.94 
 
 
144 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.885551  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1080  CHRD  55.97 
 
 
141 aa  135  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.183824 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6737  CHRD domain-containing protein  48.28 
 
 
147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1308  CHRD  52.52 
 
 
140 aa  131  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.971052  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0444  CHRD domain-containing protein  51.03 
 
 
151 aa  122  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182512  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3444  CHRD domain containing protein  50.44 
 
 
147 aa  118  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576852  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3001  chordin  45.45 
 
 
171 aa  117  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_004310  BR0022  hypothetical protein  48.36 
 
 
144 aa  115  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0352588  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2218  CHRD domain containing protein  54.62 
 
 
149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0019  hypothetical protein  47.54 
 
 
144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.229007  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2226  CHRD  48.08 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.156145  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1896  CHRD domain-containing protein  50.41 
 
 
156 aa  106  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2480  CHRD domain-containing protein  45.67 
 
 
148 aa  101  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0119714  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2966  hypothetical protein  48.98 
 
 
173 aa  99.8  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1174  CHRD domain containing protein  47.87 
 
 
140 aa  87  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0629286  normal  0.936237 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4549  CHRD domain-containing protein  44.95 
 
 
862 aa  85.9  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2082  hypothetical protein  43.3 
 
 
199 aa  78.2  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114643  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  34.78 
 
 
479 aa  72.8  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2026  CHRD domain containing protein  34.21 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3037  CHRD domain-containing protein  38.46 
 
 
170 aa  67.8  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5363  CHRD domain containing protein  34.75 
 
 
282 aa  65.5  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.974056  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37354  predicted protein  39.02 
 
 
150 aa  62  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0263858  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0581  CHRD domain-containing protein  37.82 
 
 
408 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  27.87 
 
 
819 aa  56.6  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5666  CHRD domain containing protein  30.58 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2054  CHRD domain-containing protein  36.88 
 
 
139 aa  54.7  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.332284  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0158  hypothetical protein  34.51 
 
 
513 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0541  CHRD domain containing protein  27.01 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.9695  normal  0.973428 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1716  CHRD  34.23 
 
 
145 aa  51.6  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.344065  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3145  CHRD  36.97 
 
 
413 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2824  CHRD domain-containing protein  29.03 
 
 
407 aa  48.5  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.227844  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0849  hypothetical protein  28.37 
 
 
213 aa  47.8  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.873186 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3336  CHRD domain containing protein  35.71 
 
 
412 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  30.57 
 
 
460 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3258  CHRD domain containing protein  34.82 
 
 
411 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335818  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2066  hypothetical protein  29.82 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  29.08 
 
 
652 aa  45.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2427  hypothetical protein  30.23 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  29.94 
 
 
460 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2578  hypothetical protein  26.24 
 
 
201 aa  44.7  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2354  hypothetical protein  29.46 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2174  hypothetical protein  29.46 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.324144  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2111  hypothetical protein  29.46 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000509964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2332  hypothetical protein  29.46 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1290  CHRD  28.93 
 
 
206 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.200605  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2096  hypothetical protein  26.36 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5294  hypothetical protein  24.03 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000867603 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5053  hypothetical protein  24.03 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4883  hypothetical protein  24.03 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5438  hypothetical protein  24.03 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0338  CHRD domain containing protein  30.08 
 
 
154 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4998  CHRD domain-containing protein  24.81 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0252  CHRD domain containing protein  31.31 
 
 
160 aa  40.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.705335  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>