53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2966 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2966  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  347  4e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1080  CHRD  45 
 
 		 141 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.183824 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1308  CHRD  43.84 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.971052  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2082  hypothetical protein  39.74 
 
 		 199 aa  107  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0551  CHRD domain-containing protein  50 
 
 		 144 aa  104  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6737  CHRD domain-containing protein  47.01 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3444  CHRD domain containing protein  45 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576852  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6077  CHRD domain-containing protein  40.28 
 
 		 144 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.563536 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0359  CHRD domain-containing protein  51.02 
 
 		 144 aa  100  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0538  CHRD domain-containing superfamily  46.15 
 
 		 144 aa  101  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2665  CHRD domain-containing protein  41.32 
 
 		 144 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2226  CHRD  42.19 
 
 		 152 aa  100  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.156145  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3001  chordin  43.09 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2748  CHRD domain-containing protein  46.15 
 
 		 144 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2798  CHRD domain-containing protein  41.32 
 
 		 144 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.885551  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2136  CHRD domain-containing protein  46.15 
 
 		 144 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.911321  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2774  CHRD domain-containing protein  46.15 
 
 		 144 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0650  CHRD domain-containing protein  47 
 
 		 144 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.644603  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0666  CHRD domain-containing protein  47 
 
 		 144 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4065  hypothetical protein  48.98 
 
 		 144 aa  99.8  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435271  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0170  hypothetical protein  47 
 
 		 134 aa  99  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2381  CHRD domain-containing protein  47 
 
 		 144 aa  99  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.740751  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2778  CHRD domain-containing protein  47 
 
 		 144 aa  99  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2301  CHRD domain-containing protein  47 
 
 		 144 aa  99  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.712267  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0826  hypothetical protein  47 
 
 		 144 aa  98.2  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0634  CHRD domain containing protein  46.94 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.231612  normal  0.156078 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0444  CHRD domain-containing protein  47.06 
 
 		 151 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182512  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0022  hypothetical protein  39.84 
 
 		 144 aa  91.3  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0352588  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4549  CHRD domain-containing protein  41.54 
 
 		 862 aa  90.9  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0019  hypothetical protein  39.02 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.229007  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1896  CHRD domain-containing protein  44.35 
 
 		 156 aa  84.7  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2218  CHRD domain containing protein  47.87 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1174  CHRD domain containing protein  43.16 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0629286  normal  0.936237 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2480  CHRD domain-containing protein  36.45 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0119714  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5363  CHRD domain containing protein  35 
 
 		 282 aa  65.1  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.974056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0849  hypothetical protein  33.33 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.873186 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37354  predicted protein  33.62 
 
 		 150 aa  62  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0263858  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2578  hypothetical protein  33.93 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3037  CHRD domain-containing protein  33.07 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  40.59 
 
 		 479 aa  53.9  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  31.25 
 
 		 819 aa  53.9  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3461  CHRD domain containing protein  32.89 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.664498 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5666  CHRD domain containing protein  51.16 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0541  CHRD domain containing protein  28 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.9695  normal  0.973428 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2824  CHRD domain-containing protein  30.3 
 
 		 407 aa  48.9  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.227844  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1290  CHRD  30.54 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.200605  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2026  CHRD domain containing protein  29.55 
 
 		 151 aa  45.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0158  hypothetical protein  34.33 
 
 		 513 aa  44.3  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3145  CHRD  29.91 
 
 		 413 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0581  CHRD domain-containing protein  29.41 
 
 		 408 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3863  CHRD domain containing protein  26.5 
 
 		 228 aa  41.6  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3912  CHRD domain containing protein  26.5 
 
 		 228 aa  41.6  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.525436  normal  0.480865 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  34.33 
 
 		 652 aa  41.2  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.660296 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>