74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1308 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1308  CHRD  100 
 
 		 140 aa  276  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.971052  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1080  CHRD  78.72 
 
 		 141 aa  217  3e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.183824 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6737  CHRD domain-containing protein  59.31 
 
 		 147 aa  156  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3444  CHRD domain containing protein  64.66 
 
 		 147 aa  156  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576852  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0551  CHRD domain-containing protein  64.91 
 
 		 144 aa  149  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0538  CHRD domain-containing superfamily  60.77 
 
 		 144 aa  148  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6077  CHRD domain-containing protein  56.74 
 
 		 144 aa  147  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.563536 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2381  CHRD domain-containing protein  57.04 
 
 		 144 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.740751  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2301  CHRD domain-containing protein  57.04 
 
 		 144 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.712267  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2778  CHRD domain-containing protein  57.04 
 
 		 144 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0826  hypothetical protein  57.04 
 
 		 144 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0666  CHRD domain-containing protein  56.3 
 
 		 144 aa  144  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0650  CHRD domain-containing protein  56.3 
 
 		 144 aa  144  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.644603  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2136  CHRD domain-containing protein  54.61 
 
 		 144 aa  143  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.911321  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2748  CHRD domain-containing protein  54.61 
 
 		 144 aa  143  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2774  CHRD domain-containing protein  54.61 
 
 		 144 aa  143  9e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0170  hypothetical protein  58.91 
 
 		 134 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2665  CHRD domain-containing protein  57.89 
 
 		 144 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2798  CHRD domain-containing protein  57.89 
 
 		 144 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.885551  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3001  chordin  47.59 
 
 		 171 aa  134  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0634  CHRD domain containing protein  53.24 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.231612  normal  0.156078 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4065  hypothetical protein  52.52 
 
 		 144 aa  131  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0359  CHRD domain-containing protein  48.89 
 
 		 144 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0444  CHRD domain-containing protein  64.6 
 
 		 151 aa  130  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1896  CHRD domain-containing protein  62.83 
 
 		 156 aa  127  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2226  CHRD  56.48 
 
 		 152 aa  124  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.156145  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2218  CHRD domain containing protein  54.96 
 
 		 149 aa  118  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0022  hypothetical protein  43.8 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0352588  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0019  hypothetical protein  43.07 
 
 		 144 aa  114  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.229007  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2966  hypothetical protein  43.84 
 
 		 173 aa  108  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1174  CHRD domain containing protein  47.17 
 
 		 140 aa  97.1  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0629286  normal  0.936237 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4549  CHRD domain-containing protein  44.83 
 
 		 862 aa  96.7  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2480  CHRD domain-containing protein  39.19 
 
 		 148 aa  90.9  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0119714  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2082  hypothetical protein  42.06 
 
 		 199 aa  84.7  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5363  CHRD domain containing protein  39.83 
 
 		 282 aa  84  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.974056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5666  CHRD domain containing protein  37.7 
 
 		 161 aa  77  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2026  CHRD domain containing protein  41.38 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  42.24 
 
 		 479 aa  70.9  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3037  CHRD domain-containing protein  36.84 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0581  CHRD domain-containing protein  40.87 
 
 		 408 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2824  CHRD domain-containing protein  36.97 
 
 		 407 aa  65.1  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.227844  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37354  predicted protein  31.25 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0263858  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3145  CHRD  40.71 
 
 		 413 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0158  hypothetical protein  34.11 
 
 		 513 aa  61.2  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3258  CHRD domain containing protein  39.34 
 
 		 411 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335818  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2066  hypothetical protein  33.09 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3336  CHRD domain containing protein  40 
 
 		 412 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0849  hypothetical protein  34.29 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.873186 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  35.96 
 
 		 819 aa  55.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2578  hypothetical protein  34.57 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2054  CHRD domain-containing protein  36.36 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.332284  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1716  CHRD  33.33 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.344065  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0541  CHRD domain containing protein  27.43 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.9695  normal  0.973428 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2096  hypothetical protein  29.01 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2427  hypothetical protein  29.01 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2174  hypothetical protein  29.01 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.324144  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2111  hypothetical protein  29.01 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000509964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2354  hypothetical protein  29.01 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2332  hypothetical protein  29.01 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0338  CHRD domain containing protein  30.43 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1290  CHRD  30.86 
 
 		 206 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.200605  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5053  hypothetical protein  24.43 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4883  hypothetical protein  24.43 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  26.88 
 
 		 460 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5294  hypothetical protein  24.43 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000867603 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5438  hypothetical protein  24.43 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4998  CHRD domain-containing protein  25.19 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5370  hypothetical protein  24.03 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.847309  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3954  CHRD domain containing protein  33.68 
 
 		 145 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.689351  normal  0.0638434 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5315  hypothetical protein  23.26 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4898  hypothetical protein  23.26 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5634  hypothetical protein  25.19 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.946842  hitchhiker  0.0000000000653167 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5325  hypothetical protein  25.19 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0939  CHRD domain-containing protein  33.67 
 
 		 167 aa  40.4  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>