45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2480 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2480  CHRD domain-containing protein  100 
 
 		 148 aa  295  1e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0119714  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0359  CHRD domain-containing protein  45.99 
 
 		 144 aa  107  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2748  CHRD domain-containing protein  46.85 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2136  CHRD domain-containing protein  46.85 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.911321  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2774  CHRD domain-containing protein  46.85 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0634  CHRD domain containing protein  47.24 
 
 		 144 aa  104  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.231612  normal  0.156078 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6077  CHRD domain-containing protein  45.45 
 
 		 144 aa  103  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.563536 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0551  CHRD domain-containing protein  47.54 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4065  hypothetical protein  45.67 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0538  CHRD domain-containing superfamily  43.66 
 
 		 144 aa  100  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2381  CHRD domain-containing protein  42.66 
 
 		 144 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.740751  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0170  hypothetical protein  43.8 
 
 		 134 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0666  CHRD domain-containing protein  42.66 
 
 		 144 aa  97.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2778  CHRD domain-containing protein  42.66 
 
 		 144 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2301  CHRD domain-containing protein  42.66 
 
 		 144 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.712267  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0650  CHRD domain-containing protein  42.66 
 
 		 144 aa  97.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.644603  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0826  hypothetical protein  42.66 
 
 		 144 aa  97.1  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1308  CHRD  39.19 
 
 		 140 aa  90.9  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.971052  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2798  CHRD domain-containing protein  42.62 
 
 		 144 aa  90.1  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.885551  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2665  CHRD domain-containing protein  42.62 
 
 		 144 aa  90.1  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6737  CHRD domain-containing protein  38.1 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1080  CHRD  36.88 
 
 		 141 aa  83.6  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.183824 
 
 
-
 
NC_004310  BR0022  hypothetical protein  40 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0352588  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0019  hypothetical protein  39.23 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.229007  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2966  hypothetical protein  36.45 
 
 		 173 aa  74.3  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0444  CHRD domain-containing protein  36.69 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3444  CHRD domain containing protein  38.1 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576852  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3001  chordin  31.97 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2218  CHRD domain containing protein  34.72 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1174  CHRD domain containing protein  35.25 
 
 		 140 aa  70.1  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0629286  normal  0.936237 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2226  CHRD  36.63 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.156145  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1896  CHRD domain-containing protein  38.83 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2082  hypothetical protein  31.78 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2026  CHRD domain containing protein  32.8 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3037  CHRD domain-containing protein  31.25 
 
 		 170 aa  50.4  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0252  CHRD domain containing protein  27.08 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.705335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2427  hypothetical protein  29.67 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4549  CHRD domain-containing protein  29.25 
 
 		 862 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5363  CHRD domain containing protein  25 
 
 		 282 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.974056  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2096  hypothetical protein  30.34 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2174  hypothetical protein  29.67 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.324144  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2111  hypothetical protein  29.67 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000509964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2354  hypothetical protein  29.67 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2332  hypothetical protein  29.67 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  34.41 
 
 		 479 aa  40.4  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>