49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0022 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0022  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  300  3.0000000000000004e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0352588  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0019  hypothetical protein  99.31 
 
 		 144 aa  299  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.229007  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0359  CHRD domain-containing protein  45.99 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0666  CHRD domain-containing protein  49.23 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0650  CHRD domain-containing protein  49.23 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.644603  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2381  CHRD domain-containing protein  48.46 
 
 		 144 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.740751  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2301  CHRD domain-containing protein  48.46 
 
 		 144 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.712267  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2778  CHRD domain-containing protein  48.46 
 
 		 144 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0170  hypothetical protein  48.46 
 
 		 134 aa  123  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0826  hypothetical protein  48.46 
 
 		 144 aa  123  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2774  CHRD domain-containing protein  45.39 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0538  CHRD domain-containing superfamily  50.41 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2748  CHRD domain-containing protein  45.39 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2136  CHRD domain-containing protein  45.39 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.911321  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6077  CHRD domain-containing protein  44.68 
 
 		 144 aa  120  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.563536 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0634  CHRD domain containing protein  49.18 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.231612  normal  0.156078 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0551  CHRD domain-containing protein  47.9 
 
 		 144 aa  117  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4065  hypothetical protein  48.36 
 
 		 144 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1308  CHRD  43.8 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.971052  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2665  CHRD domain-containing protein  47.06 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2798  CHRD domain-containing protein  47.06 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.885551  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1080  CHRD  39.42 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.183824 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3444  CHRD domain containing protein  45.69 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576852  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6737  CHRD domain-containing protein  39.86 
 
 		 147 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0444  CHRD domain-containing protein  43.17 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182512  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2966  hypothetical protein  39.84 
 
 		 173 aa  91.3  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2226  CHRD  41.43 
 
 		 152 aa  90.1  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.156145  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3001  chordin  41.46 
 
 		 171 aa  87  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2082  hypothetical protein  36.88 
 
 		 199 aa  84.7  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2218  CHRD domain containing protein  40.43 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1896  CHRD domain-containing protein  43.44 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1174  CHRD domain containing protein  41.18 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0629286  normal  0.936237 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2480  CHRD domain-containing protein  40 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0119714  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4549  CHRD domain-containing protein  36.89 
 
 		 862 aa  63.9  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  34.88 
 
 		 479 aa  58.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37354  predicted protein  38.1 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0263858  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5363  CHRD domain containing protein  31.3 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.974056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0849  hypothetical protein  31.82 
 
 		 213 aa  50.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.873186 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  26.83 
 
 		 819 aa  47.4  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3037  CHRD domain-containing protein  30.58 
 
 		 170 aa  46.2  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1290  CHRD  26.71 
 
 		 206 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.200605  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0541  CHRD domain containing protein  28.36 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.9695  normal  0.973428 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0581  CHRD domain-containing protein  44 
 
 		 408 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2003  hypothetical protein  45.95 
 
 		 237 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2026  CHRD domain containing protein  28.57 
 
 		 151 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3258  CHRD domain containing protein  55.88 
 
 		 411 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335818  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2824  CHRD domain-containing protein  23.74 
 
 		 407 aa  40  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.227844  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1716  CHRD  30.83 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.344065  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  29.75 
 
 		 652 aa  40  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.660296 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>