70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2136 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_2748  CHRD domain-containing protein  100 
 
 		 144 aa  292  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2136  CHRD domain-containing protein  100 
 
 		 144 aa  292  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.911321  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2774  CHRD domain-containing protein  100 
 
 		 144 aa  292  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6077  CHRD domain-containing protein  93.06 
 
 		 144 aa  275  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.563536 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2665  CHRD domain-containing protein  88.19 
 
 		 144 aa  244  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2798  CHRD domain-containing protein  88.89 
 
 		 144 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.885551  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0551  CHRD domain-containing protein  81.94 
 
 		 144 aa  228  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0538  CHRD domain-containing superfamily  76.39 
 
 		 144 aa  227  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2381  CHRD domain-containing protein  73.61 
 
 		 144 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.740751  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2778  CHRD domain-containing protein  73.61 
 
 		 144 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2301  CHRD domain-containing protein  73.61 
 
 		 144 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.712267  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0666  CHRD domain-containing protein  72.92 
 
 		 144 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0650  CHRD domain-containing protein  72.92 
 
 		 144 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.644603  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0826  hypothetical protein  72.92 
 
 		 144 aa  216  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0170  hypothetical protein  75.37 
 
 		 134 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4065  hypothetical protein  66.67 
 
 		 144 aa  200  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0634  CHRD domain containing protein  66.67 
 
 		 144 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.231612  normal  0.156078 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0359  CHRD domain-containing protein  63.19 
 
 		 144 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1080  CHRD  56.62 
 
 		 141 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.183824 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1308  CHRD  54.61 
 
 		 140 aa  143  9e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.971052  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6737  CHRD domain-containing protein  52.99 
 
 		 147 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3444  CHRD domain containing protein  56.41 
 
 		 147 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576852  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0022  hypothetical protein  45.39 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0352588  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0019  hypothetical protein  44.68 
 
 		 144 aa  120  6e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.229007  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3001  chordin  45.38 
 
 		 171 aa  120  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2218  CHRD domain containing protein  47.55 
 
 		 149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0444  CHRD domain-containing protein  50.36 
 
 		 151 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2226  CHRD  45.38 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.156145  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1896  CHRD domain-containing protein  47.73 
 
 		 156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2480  CHRD domain-containing protein  46.85 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0119714  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2966  hypothetical protein  46.15 
 
 		 173 aa  100  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1174  CHRD domain containing protein  44.07 
 
 		 140 aa  93.2  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0629286  normal  0.936237 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4549  CHRD domain-containing protein  39.67 
 
 		 862 aa  91.3  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2082  hypothetical protein  41.58 
 
 		 199 aa  77.8  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5363  CHRD domain containing protein  33.78 
 
 		 282 aa  77.8  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.974056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  40.17 
 
 		 479 aa  72.4  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5666  CHRD domain containing protein  29.3 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3037  CHRD domain-containing protein  35.9 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2026  CHRD domain containing protein  36.21 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0158  hypothetical protein  34.86 
 
 		 513 aa  63.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2824  CHRD domain-containing protein  29.63 
 
 		 407 aa  59.7  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.227844  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0581  CHRD domain-containing protein  38.46 
 
 		 408 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2054  CHRD domain-containing protein  34.75 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.332284  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37354  predicted protein  34.38 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0263858  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3258  CHRD domain containing protein  37.61 
 
 		 411 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335818  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  28.15 
 
 		 819 aa  55.5  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1716  CHRD  36.03 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.344065  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3336  CHRD domain containing protein  36.75 
 
 		 412 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0541  CHRD domain containing protein  24.09 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.9695  normal  0.973428 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0849  hypothetical protein  32 
 
 		 213 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.873186 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3145  CHRD  37.61 
 
 		 413 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2066  hypothetical protein  33.09 
 
 		 150 aa  51.6  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1290  CHRD  31.71 
 
 		 206 aa  51.6  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.200605  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2578  hypothetical protein  26.06 
 
 		 201 aa  51.6  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2427  hypothetical protein  31.01 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2174  hypothetical protein  26.36 
 
 		 132 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.324144  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2354  hypothetical protein  26.36 
 
 		 132 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2111  hypothetical protein  26.36 
 
 		 132 aa  47.8  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000509964  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2096  hypothetical protein  25.58 
 
 		 132 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2332  hypothetical protein  26.36 
 
 		 132 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  34.33 
 
 		 652 aa  45.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4998  CHRD domain-containing protein  26.12 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0338  CHRD domain containing protein  28.46 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5294  hypothetical protein  25.37 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000867603 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5053  hypothetical protein  25.37 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  26.32 
 
 		 460 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4883  hypothetical protein  25.37 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5438  hypothetical protein  25.37 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5370  hypothetical protein  23.88 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.847309  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  26 
 
 		 460 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>