43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5666 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5666  CHRD domain containing protein  100 
 
 		 161 aa  327  6e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1308  CHRD  37.7 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.971052  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1080  CHRD  36.89 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.183824 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1896  CHRD domain-containing protein  34.96 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2026  CHRD domain containing protein  33.11 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4549  CHRD domain-containing protein  36.57 
 
 		 862 aa  69.7  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6077  CHRD domain-containing protein  29.3 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.563536 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2774  CHRD domain-containing protein  29.3 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2136  CHRD domain-containing protein  29.3 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.911321  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2748  CHRD domain-containing protein  29.3 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0538  CHRD domain-containing superfamily  30.38 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3001  chordin  33.33 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6737  CHRD domain-containing protein  35 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2665  CHRD domain-containing protein  30.08 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2226  CHRD  31.67 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.156145  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2798  CHRD domain-containing protein  30.08 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.885551  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2381  CHRD domain-containing protein  31.71 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.740751  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2778  CHRD domain-containing protein  31.71 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3444  CHRD domain containing protein  33.33 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2301  CHRD domain-containing protein  31.71 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.712267  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0170  hypothetical protein  31.71 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0826  hypothetical protein  31.71 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0650  CHRD domain-containing protein  31.71 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.644603  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0666  CHRD domain-containing protein  31.71 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0551  CHRD domain-containing protein  29.11 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3037  CHRD domain-containing protein  31.54 
 
 		 170 aa  60.5  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2218  CHRD domain containing protein  32.5 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0359  CHRD domain-containing protein  30.89 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4065  hypothetical protein  30.58 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0634  CHRD domain containing protein  30.08 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.231612  normal  0.156078 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0444  CHRD domain-containing protein  34.4 
 
 		 151 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5363  CHRD domain containing protein  28.4 
 
 		 282 aa  50.8  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.974056  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2966  hypothetical protein  51.16 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2066  hypothetical protein  31.75 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0158  hypothetical protein  29.06 
 
 		 513 aa  47.8  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1174  CHRD domain containing protein  28.3 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0629286  normal  0.936237 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1716  CHRD  27.04 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.344065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2427  hypothetical protein  27.48 
 
 		 132 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3258  CHRD domain containing protein  28 
 
 		 411 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335818  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2082  hypothetical protein  35.85 
 
 		 199 aa  41.6  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  48.57 
 
 		 479 aa  41.6  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3145  CHRD  28 
 
 		 413 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2096  hypothetical protein  26.72 
 
 		 132 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>