60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2066 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2066  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  306  4e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1716  CHRD  50 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.344065  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2054  CHRD domain-containing protein  46.67 
 
 
139 aa  104  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.332284  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  40.57 
 
 
819 aa  77.4  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3145  CHRD  41.44 
 
 
413 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3258  CHRD domain containing protein  35 
 
 
411 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335818  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0581  CHRD domain-containing protein  38.74 
 
 
408 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3336  CHRD domain containing protein  34.17 
 
 
412 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1308  CHRD  33.09 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.971052  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0158  hypothetical protein  33.62 
 
 
513 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4549  CHRD domain-containing protein  35.96 
 
 
862 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  34.11 
 
 
479 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2096  hypothetical protein  32.28 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0551  CHRD domain-containing protein  34.21 
 
 
144 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2026  CHRD domain containing protein  34.48 
 
 
151 aa  53.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1080  CHRD  33.64 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.183824 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2748  CHRD domain-containing protein  33.09 
 
 
144 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2136  CHRD domain-containing protein  33.09 
 
 
144 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.911321  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2774  CHRD domain-containing protein  33.09 
 
 
144 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6737  CHRD domain-containing protein  31.85 
 
 
147 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3037  CHRD domain-containing protein  32.77 
 
 
170 aa  51.6  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2427  hypothetical protein  31.5 
 
 
132 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2354  hypothetical protein  30.4 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2174  hypothetical protein  30.4 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.324144  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2332  hypothetical protein  30.4 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2111  hypothetical protein  30.4 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000509964  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6077  CHRD domain-containing protein  32.12 
 
 
144 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.563536 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0338  CHRD domain containing protein  34.09 
 
 
154 aa  50.8  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3444  CHRD domain containing protein  33.04 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576852  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2798  CHRD domain-containing protein  31.9 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.885551  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2665  CHRD domain-containing protein  31.9 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1194  hypothetical protein  37.68 
 
 
531 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2226  CHRD  33.33 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.156145  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5666  CHRD domain containing protein  31.75 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0826  hypothetical protein  29.29 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2381  CHRD domain-containing protein  32.43 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.740751  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0666  CHRD domain-containing protein  32.43 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0650  CHRD domain-containing protein  32.43 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.644603  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2301  CHRD domain-containing protein  32.43 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.712267  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0170  hypothetical protein  32.43 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2778  CHRD domain-containing protein  32.43 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0359  CHRD domain-containing protein  28.47 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0634  CHRD domain containing protein  31.16 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.231612  normal  0.156078 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0538  CHRD domain-containing superfamily  31.53 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4998  CHRD domain-containing protein  27.69 
 
 
137 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  27.85 
 
 
652 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2824  CHRD domain-containing protein  32.17 
 
 
407 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.227844  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4065  hypothetical protein  29.82 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435271  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5370  hypothetical protein  25 
 
 
137 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.847309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5438  hypothetical protein  25 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0444  CHRD domain-containing protein  32.46 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182512  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4898  hypothetical protein  25 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4883  hypothetical protein  25 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5294  hypothetical protein  25 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000867603 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5053  hypothetical protein  25 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5315  hypothetical protein  25 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3001  chordin  29.31 
 
 
171 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1896  CHRD domain-containing protein  29.57 
 
 
156 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5363  CHRD domain containing protein  32.23 
 
 
282 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.974056  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2218  CHRD domain containing protein  28.45 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>