64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0666 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_0666  CHRD domain-containing protein  100 
 
 
144 aa  293  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0650  CHRD domain-containing protein  100 
 
 
144 aa  293  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.644603  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2778  CHRD domain-containing protein  99.31 
 
 
144 aa  292  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2381  CHRD domain-containing protein  99.31 
 
 
144 aa  292  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.740751  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2301  CHRD domain-containing protein  99.31 
 
 
144 aa  292  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.712267  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0826  hypothetical protein  98.61 
 
 
144 aa  290  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0538  CHRD domain-containing superfamily  90.97 
 
 
144 aa  274  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0170  hypothetical protein  99.25 
 
 
134 aa  273  7e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2748  CHRD domain-containing protein  72.92 
 
 
144 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2136  CHRD domain-containing protein  72.92 
 
 
144 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.911321  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2774  CHRD domain-containing protein  72.92 
 
 
144 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6077  CHRD domain-containing protein  73.61 
 
 
144 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.563536 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0551  CHRD domain-containing protein  74.31 
 
 
144 aa  209  9e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2665  CHRD domain-containing protein  72.22 
 
 
144 aa  207  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0359  CHRD domain-containing protein  65.28 
 
 
144 aa  204  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2798  CHRD domain-containing protein  78.51 
 
 
144 aa  203  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.885551  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0634  CHRD domain containing protein  66.67 
 
 
144 aa  201  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.231612  normal  0.156078 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4065  hypothetical protein  65.97 
 
 
144 aa  201  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435271  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1080  CHRD  57.89 
 
 
141 aa  146  9e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.183824 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1308  CHRD  56.3 
 
 
140 aa  144  6e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.971052  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6737  CHRD domain-containing protein  49.65 
 
 
147 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3444  CHRD domain containing protein  54.7 
 
 
147 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576852  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0022  hypothetical protein  49.23 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0352588  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0019  hypothetical protein  48.46 
 
 
144 aa  123  7e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.229007  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3001  chordin  47.15 
 
 
171 aa  122  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2226  CHRD  41.43 
 
 
152 aa  114  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.156145  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0444  CHRD domain-containing protein  53.72 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182512  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2218  CHRD domain containing protein  50.41 
 
 
149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1896  CHRD domain-containing protein  46.21 
 
 
156 aa  103  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2966  hypothetical protein  47 
 
 
173 aa  99.4  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2480  CHRD domain-containing protein  42.66 
 
 
148 aa  97.4  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0119714  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4549  CHRD domain-containing protein  40 
 
 
862 aa  90.1  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1174  CHRD domain containing protein  44.07 
 
 
140 aa  87.4  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0629286  normal  0.936237 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2082  hypothetical protein  36.62 
 
 
199 aa  85.1  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114643  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5363  CHRD domain containing protein  36.36 
 
 
282 aa  74.3  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.974056  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3037  CHRD domain-containing protein  42.59 
 
 
170 aa  73.9  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  40.83 
 
 
479 aa  72  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2026  CHRD domain containing protein  36.21 
 
 
151 aa  63.5  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5666  CHRD domain containing protein  31.71 
 
 
161 aa  62.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0581  CHRD domain-containing protein  39.52 
 
 
408 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3145  CHRD  42.74 
 
 
413 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0158  hypothetical protein  37.84 
 
 
513 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3258  CHRD domain containing protein  41.94 
 
 
411 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335818  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0849  hypothetical protein  34 
 
 
213 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.873186 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2054  CHRD domain-containing protein  36.11 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.332284  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  31.03 
 
 
819 aa  56.6  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3336  CHRD domain containing protein  41.13 
 
 
412 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37354  predicted protein  33.77 
 
 
150 aa  54.3  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0263858  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2824  CHRD domain-containing protein  32 
 
 
407 aa  53.9  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.227844  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0541  CHRD domain containing protein  26.47 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.9695  normal  0.973428 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1716  CHRD  32.58 
 
 
145 aa  50.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.344065  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1290  CHRD  31.25 
 
 
206 aa  50.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.200605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2427  hypothetical protein  30.53 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0338  CHRD domain containing protein  32.14 
 
 
154 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2354  hypothetical protein  28.57 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2332  hypothetical protein  28.57 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2174  hypothetical protein  28.57 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.324144  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2111  hypothetical protein  28.57 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000509964  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2096  hypothetical protein  27.82 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2066  hypothetical protein  32.43 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2578  hypothetical protein  26.71 
 
 
201 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4998  CHRD domain-containing protein  24.63 
 
 
137 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  34.33 
 
 
652 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0939  CHRD domain-containing protein  32.39 
 
 
167 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>