73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2218 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2218  CHRD domain containing protein  100 
 
 		 149 aa  299  9e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3001  chordin  54.42 
 
 		 171 aa  168  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1896  CHRD domain-containing protein  65.38 
 
 		 156 aa  150  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2226  CHRD  51.35 
 
 		 152 aa  142  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.156145  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1308  CHRD  54.96 
 
 		 140 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.971052  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1080  CHRD  61.11 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.183824 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6077  CHRD domain-containing protein  49.65 
 
 		 144 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.563536 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0634  CHRD domain containing protein  49.3 
 
 		 144 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.231612  normal  0.156078 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2774  CHRD domain-containing protein  47.55 
 
 		 144 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2136  CHRD domain-containing protein  47.55 
 
 		 144 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.911321  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2748  CHRD domain-containing protein  47.55 
 
 		 144 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0359  CHRD domain-containing protein  46.48 
 
 		 144 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6737  CHRD domain-containing protein  57.14 
 
 		 147 aa  130  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0551  CHRD domain-containing protein  52.94 
 
 		 144 aa  130  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4065  hypothetical protein  54.62 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0538  CHRD domain-containing superfamily  47.89 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0650  CHRD domain-containing protein  50.41 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.644603  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2798  CHRD domain-containing protein  52.1 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.885551  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2665  CHRD domain-containing protein  52.1 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0666  CHRD domain-containing protein  50.41 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2778  CHRD domain-containing protein  49.59 
 
 		 144 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2301  CHRD domain-containing protein  49.59 
 
 		 144 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.712267  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2381  CHRD domain-containing protein  49.59 
 
 		 144 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.740751  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0826  hypothetical protein  49.59 
 
 		 144 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0170  hypothetical protein  49.59 
 
 		 134 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3444  CHRD domain containing protein  53.57 
 
 		 147 aa  124  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576852  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0444  CHRD domain-containing protein  55.36 
 
 		 151 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182512  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2966  hypothetical protein  47.87 
 
 		 173 aa  97.1  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1174  CHRD domain containing protein  40.56 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0629286  normal  0.936237 
 
 
-
 
NC_004310  BR0022  hypothetical protein  40.43 
 
 		 144 aa  94.4  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0352588  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0019  hypothetical protein  40.43 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.229007  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4549  CHRD domain-containing protein  42.34 
 
 		 862 aa  89.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2480  CHRD domain-containing protein  35.42 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0119714  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5363  CHRD domain containing protein  33.9 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.974056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0158  hypothetical protein  39.64 
 
 		 513 aa  79  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2082  hypothetical protein  46.99 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2026  CHRD domain containing protein  38.02 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3037  CHRD domain-containing protein  37.72 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5666  CHRD domain containing protein  32.5 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  29.91 
 
 		 819 aa  63.9  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37354  predicted protein  35.65 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0263858  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0581  CHRD domain-containing protein  37.6 
 
 		 408 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  39.32 
 
 		 479 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2096  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2354  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5294  hypothetical protein  27.61 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000867603 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5053  hypothetical protein  27.61 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2174  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.324144  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2111  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000509964  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4883  hypothetical protein  27.61 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5438  hypothetical protein  27.61 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2332  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0541  CHRD domain containing protein  27.97 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.9695  normal  0.973428 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2054  CHRD domain-containing protein  37.61 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.332284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2427  hypothetical protein  31.82 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3145  CHRD  33.76 
 
 		 413 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4998  CHRD domain-containing protein  27.61 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3258  CHRD domain containing protein  36.04 
 
 		 411 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335818  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5325  hypothetical protein  26.12 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5634  hypothetical protein  26.12 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.946842  hitchhiker  0.0000000000653167 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3336  CHRD domain containing protein  31.85 
 
 		 412 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4898  hypothetical protein  25.37 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5315  hypothetical protein  25.37 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2578  hypothetical protein  28.86 
 
 		 201 aa  47.8  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1716  CHRD  30.88 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.344065  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3461  CHRD domain containing protein  28.57 
 
 		 211 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.664498 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5370  hypothetical protein  24.63 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.847309  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0338  CHRD domain containing protein  29.69 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2824  CHRD domain-containing protein  32.2 
 
 		 407 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.227844  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2066  hypothetical protein  29.91 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2003  hypothetical protein  44.74 
 
 		 237 aa  40.8  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3954  CHRD domain containing protein  35.23 
 
 		 145 aa  40  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.689351  normal  0.0638434 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1290  CHRD  27.27 
 
 		 206 aa  40  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.200605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>