45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0541 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0541  CHRD domain containing protein  100 
 
 		 137 aa  281  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.9695  normal  0.973428 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1080  CHRD  30.09 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.183824 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0551  CHRD domain-containing protein  29.75 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0634  CHRD domain containing protein  27.94 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.231612  normal  0.156078 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1308  CHRD  27.43 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.971052  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0538  CHRD domain-containing superfamily  27.41 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2136  CHRD domain-containing protein  24.09 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.911321  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2774  CHRD domain-containing protein  24.09 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2748  CHRD domain-containing protein  24.09 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4065  hypothetical protein  27.01 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  31.54 
 
 		 819 aa  51.6  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3001  chordin  28.12 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0826  hypothetical protein  26.47 
 
 		 144 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0666  CHRD domain-containing protein  26.47 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2301  CHRD domain-containing protein  26.47 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.712267  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0650  CHRD domain-containing protein  26.47 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.644603  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2778  CHRD domain-containing protein  26.47 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2381  CHRD domain-containing protein  26.47 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.740751  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2218  CHRD domain containing protein  26.89 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0170  hypothetical protein  28.1 
 
 		 134 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2966  hypothetical protein  28 
 
 		 173 aa  50.1  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0359  CHRD domain-containing protein  27.05 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5363  CHRD domain containing protein  23.74 
 
 		 282 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.974056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1896  CHRD domain-containing protein  27.5 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6077  CHRD domain-containing protein  26.27 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.563536 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4549  CHRD domain-containing protein  29.2 
 
 		 862 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2082  hypothetical protein  29.52 
 
 		 199 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3037  CHRD domain-containing protein  29.31 
 
 		 170 aa  47  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2798  CHRD domain-containing protein  25.42 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.885551  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0338  CHRD domain containing protein  26.19 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6737  CHRD domain-containing protein  26.55 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2665  CHRD domain-containing protein  25.42 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37354  predicted protein  29.17 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0263858  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0022  hypothetical protein  28.36 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0352588  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0581  CHRD domain-containing protein  31.86 
 
 		 408 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3444  CHRD domain containing protein  26.55 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576852  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2226  CHRD  26.67 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.156145  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0019  hypothetical protein  50 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.229007  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2096  hypothetical protein  25 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  27.83 
 
 		 479 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2427  hypothetical protein  25 
 
 		 132 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2332  hypothetical protein  24.22 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2354  hypothetical protein  24.22 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2111  hypothetical protein  24.22 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000509964  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2174  hypothetical protein  24.22 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.324144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>