114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01014 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  100 
 
 		 819 aa  1620    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3223  hypothetical protein  44.64 
 
 		 469 aa  311  4e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4613  hypothetical protein  40.75 
 
 		 452 aa  282  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2678  hypothetical protein  42.6 
 
 		 455 aa  266  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176032  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002699  hypothetical protein  39.69 
 
 		 442 aa  221  5e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174036  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03285  hypothetical protein  36.85 
 
 		 452 aa  204  4e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0581  CHRD domain-containing protein  40.3 
 
 		 408 aa  154  8e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  32.53 
 
 		 479 aa  141  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3145  CHRD  37.5 
 
 		 413 aa  137  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3258  CHRD domain containing protein  37.27 
 
 		 411 aa  137  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335818  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3336  CHRD domain containing protein  36.11 
 
 		 412 aa  135  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2803  hypothetical protein  30.91 
 
 		 715 aa  121  4.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.549688  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4549  CHRD domain-containing protein  27.09 
 
 		 862 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  29.13 
 
 		 652 aa  98.6  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5363  CHRD domain containing protein  31.89 
 
 		 282 aa  95.9  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.974056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2824  CHRD domain-containing protein  32.65 
 
 		 407 aa  87  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.227844  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2144  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  34.21 
 
 		 261 aa  85.9  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.891643  hitchhiker  0.000531775 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2469  cell wall anchor domain-containing protein  31.55 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2340  cell wall anchor domain-containing protein  32.8 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2066  hypothetical protein  40.57 
 
 		 150 aa  77.4  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1716  CHRD  39.05 
 
 		 145 aa  76.3  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.344065  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2054  CHRD domain-containing protein  44.34 
 
 		 139 aa  76.3  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.332284  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0598  hypothetical protein  35.67 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0158  hypothetical protein  35.85 
 
 		 513 aa  75.1  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3646  putative lipoprotein  31.02 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.499343  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2068  hypothetical protein  33.68 
 
 		 317 aa  69.3  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270078  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0999  cell wall anchor domain-containing protein  30.34 
 
 		 224 aa  69.3  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000353845  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3037  CHRD domain-containing protein  39.47 
 
 		 170 aa  69.3  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3001  chordin  33.88 
 
 		 171 aa  68.6  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2171  hypothetical protein  27.41 
 
 		 217 aa  65.9  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.221923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2226  CHRD  32.03 
 
 		 152 aa  63.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.156145  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2174  hypothetical protein  31.25 
 
 		 132 aa  62.4  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.324144  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2111  hypothetical protein  31.25 
 
 		 132 aa  62.4  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000509964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2332  hypothetical protein  31.25 
 
 		 132 aa  62.4  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3778  hypothetical protein  27.54 
 
 		 260 aa  62.4  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157644  normal  0.0998357 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2354  hypothetical protein  31.25 
 
 		 132 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3890  hypothetical protein  27.54 
 
 		 260 aa  62.4  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0338  CHRD domain containing protein  30.08 
 
 		 154 aa  61.2  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2427  hypothetical protein  31.25 
 
 		 132 aa  61.2  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0551  CHRD domain-containing protein  30.7 
 
 		 144 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1389  hypothetical protein  27.36 
 
 		 232 aa  58.9  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0507165 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0359  CHRD domain-containing protein  40.17 
 
 		 144 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2096  hypothetical protein  30.47 
 
 		 132 aa  58.2  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2218  CHRD domain containing protein  29.46 
 
 		 149 aa  57.8  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2179  putative lipoprotein  27.89 
 
 		 253 aa  57  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.255362  normal  0.223351 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0170  hypothetical protein  31.03 
 
 		 134 aa  56.6  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0826  hypothetical protein  31.03 
 
 		 144 aa  56.6  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4065  hypothetical protein  27.87 
 
 		 144 aa  56.6  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2778  CHRD domain-containing protein  31.03 
 
 		 144 aa  56.6  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2301  CHRD domain-containing protein  31.03 
 
 		 144 aa  56.6  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.712267  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0650  CHRD domain-containing protein  31.03 
 
 		 144 aa  56.6  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.644603  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0666  CHRD domain-containing protein  31.03 
 
 		 144 aa  56.6  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2381  CHRD domain-containing protein  31.03 
 
 		 144 aa  56.6  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.740751  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1378  hypothetical protein  35.11 
 
 		 273 aa  56.2  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1308  CHRD  35.96 
 
 		 140 aa  55.8  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.971052  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0444  CHRD domain-containing protein  34.48 
 
 		 151 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0538  CHRD domain-containing superfamily  31.03 
 
 		 144 aa  55.5  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6737  CHRD domain-containing protein  38.6 
 
 		 147 aa  55.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2136  CHRD domain-containing protein  28.15 
 
 		 144 aa  55.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.911321  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2748  CHRD domain-containing protein  28.15 
 
 		 144 aa  55.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2774  CHRD domain-containing protein  28.15 
 
 		 144 aa  55.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6077  CHRD domain-containing protein  29.63 
 
 		 144 aa  55.1  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.563536 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0634  CHRD domain containing protein  27.05 
 
 		 144 aa  54.7  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.231612  normal  0.156078 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2966  hypothetical protein  31.25 
 
 		 173 aa  53.9  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2798  CHRD domain-containing protein  35.66 
 
 		 144 aa  53.9  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.885551  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2665  CHRD domain-containing protein  35.66 
 
 		 144 aa  53.9  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2036  hypothetical protein  24.48 
 
 		 254 aa  52.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103876  normal  0.167433 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05210  hypothetical protein  25.89 
 
 		 207 aa  53.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.193407  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2274  hypothetical protein  29.46 
 
 		 249 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2401  hypothetical protein  30.7 
 
 		 249 aa  52  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2326  hypothetical protein  30.7 
 
 		 249 aa  52  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101216  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3444  CHRD domain containing protein  31.9 
 
 		 147 aa  52  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576852  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0541  CHRD domain containing protein  31.54 
 
 		 137 aa  51.6  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.9695  normal  0.973428 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4555  hypothetical protein  23.33 
 
 		 255 aa  51.6  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.587394 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3050  hypothetical protein  30.7 
 
 		 249 aa  51.6  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2087  CHRD domain containing protein  37.5 
 
 		 729 aa  51.2  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.090076 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1089  hypothetical protein  29.41 
 
 		 359 aa  50.4  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1347  putative lipoprotein  30 
 
 		 322 aa  50.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2003  hypothetical protein  33.78 
 
 		 237 aa  50.4  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1325  hypothetical protein  28 
 
 		 351 aa  50.4  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.213882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3121  hypothetical protein  30 
 
 		 328 aa  50.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.583766  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2996  hypothetical protein  30 
 
 		 328 aa  50.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5822  hypothetical protein  35.16 
 
 		 234 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679921  hitchhiker  0.00490429 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2662  putative lipoprotein  26.69 
 
 		 264 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.524539 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0939  CHRD domain-containing protein  36.62 
 
 		 167 aa  50.8  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2138  hypothetical protein  29.82 
 
 		 249 aa  49.7  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2076  hypothetical protein  29.82 
 
 		 249 aa  49.7  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2292  hypothetical protein  29.82 
 
 		 251 aa  50.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1896  CHRD domain-containing protein  26.67 
 
 		 156 aa  49.7  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2317  hypothetical protein  29.82 
 
 		 249 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2072  hypothetical protein  28.95 
 
 		 249 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.562023  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1080  CHRD  35.09 
 
 		 141 aa  49.3  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.183824 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2111  hypothetical protein  25.56 
 
 		 249 aa  49.3  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3491  hypothetical protein  27.04 
 
 		 253 aa  48.5  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000451497 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1453  putative lipoprotein  25.47 
 
 		 264 aa  47.8  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.219204 
 
 
-
 
NC_004310  BR0022  hypothetical protein  26.83 
 
 		 144 aa  47.4  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0352588  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4333  hypothetical protein  27.04 
 
 		 253 aa  47.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663508  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3415  hypothetical protein  22.08 
 
 		 457 aa  47  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.636274 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4033  hypothetical protein  27.04 
 
 		 253 aa  47.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0019  hypothetical protein  26.83 
 
 		 144 aa  47.4  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.229007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>