25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1453 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1453  putative lipoprotein  100 
 
 
264 aa  524  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.219204 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2662  putative lipoprotein  95.45 
 
 
264 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.524539 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1514  putative lipoprotein  73.86 
 
 
262 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.918072  normal  0.757396 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3946  hypothetical protein  51.75 
 
 
253 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.359138  normal  0.604331 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3439  hypothetical protein  51.36 
 
 
253 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.595275  normal  0.0623525 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4333  hypothetical protein  49.81 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663508  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4033  hypothetical protein  49.81 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.26981  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3491  hypothetical protein  49.81 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000451497 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3121  hypothetical protein  50.19 
 
 
328 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.583766  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1347  putative lipoprotein  50.19 
 
 
322 aa  251  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2996  hypothetical protein  50.19 
 
 
328 aa  251  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2036  hypothetical protein  49.42 
 
 
254 aa  248  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103876  normal  0.167433 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4555  hypothetical protein  48.06 
 
 
255 aa  246  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.587394 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3778  hypothetical protein  46.54 
 
 
260 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157644  normal  0.0998357 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3890  hypothetical protein  46.54 
 
 
260 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3646  putative lipoprotein  46.29 
 
 
264 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.499343  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2179  putative lipoprotein  38.43 
 
 
253 aa  150  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.255362  normal  0.223351 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4613  hypothetical protein  27.57 
 
 
452 aa  62  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002699  hypothetical protein  29.03 
 
 
442 aa  55.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174036  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03285  hypothetical protein  26.26 
 
 
452 aa  49.7  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  25.47 
 
 
819 aa  47.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2678  hypothetical protein  28.06 
 
 
455 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176032  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2144  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  29.41 
 
 
261 aa  43.5  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.891643  hitchhiker  0.000531775 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3223  hypothetical protein  25.67 
 
 
469 aa  42.7  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2171  hypothetical protein  28.81 
 
 
217 aa  42.7  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.221923  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>