23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3946 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3946  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  507  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.359138  normal  0.604331 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3439  hypothetical protein  97.63 
 
 		 253 aa  497  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.595275  normal  0.0623525 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4333  hypothetical protein  88.14 
 
 		 253 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663508  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4033  hypothetical protein  88.14 
 
 		 253 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2036  hypothetical protein  87.4 
 
 		 254 aa  455  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103876  normal  0.167433 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3491  hypothetical protein  87.35 
 
 		 253 aa  454  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000451497 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4555  hypothetical protein  87.84 
 
 		 255 aa  455  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.587394 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1347  putative lipoprotein  79.05 
 
 		 322 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2996  hypothetical protein  79.05 
 
 		 328 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3121  hypothetical protein  79.45 
 
 		 328 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.583766  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2662  putative lipoprotein  53.7 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.524539 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1514  putative lipoprotein  53.33 
 
 		 262 aa  259  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.918072  normal  0.757396 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1453  putative lipoprotein  51.75 
 
 		 264 aa  258  9e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.219204 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3778  hypothetical protein  47.47 
 
 		 260 aa  231  9e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157644  normal  0.0998357 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3890  hypothetical protein  47.47 
 
 		 260 aa  231  9e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3646  putative lipoprotein  48.05 
 
 		 264 aa  219  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.499343  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2179  putative lipoprotein  46.4 
 
 		 253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.255362  normal  0.223351 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4137  hypothetical protein  28.17 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.257203 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002699  hypothetical protein  26.94 
 
 		 442 aa  55.5  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174036  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2678  hypothetical protein  25.13 
 
 		 455 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176032  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3568  hypothetical protein  21.52 
 
 		 456 aa  48.5  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000948267  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  28.49 
 
 		 819 aa  45.4  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2171  hypothetical protein  28.57 
 
 		 217 aa  43.9  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.221923  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>