23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2662 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2662  putative lipoprotein  100 
 
 
264 aa  525  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.524539 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1453  putative lipoprotein  95.45 
 
 
264 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.219204 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1514  putative lipoprotein  75 
 
 
262 aa  401  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.918072  normal  0.757396 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3946  hypothetical protein  53.7 
 
 
253 aa  267  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.359138  normal  0.604331 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3439  hypothetical protein  53.31 
 
 
253 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.595275  normal  0.0623525 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3491  hypothetical protein  50.58 
 
 
253 aa  255  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000451497 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3121  hypothetical protein  50.58 
 
 
328 aa  255  6e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.583766  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2036  hypothetical protein  50.97 
 
 
254 aa  255  6e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103876  normal  0.167433 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4033  hypothetical protein  50.58 
 
 
253 aa  255  7e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.26981  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4333  hypothetical protein  50.58 
 
 
253 aa  255  7e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663508  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2996  hypothetical protein  50.58 
 
 
328 aa  254  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1347  putative lipoprotein  50.58 
 
 
322 aa  254  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4555  hypothetical protein  49.22 
 
 
255 aa  251  7e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.587394 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3890  hypothetical protein  46.92 
 
 
260 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3778  hypothetical protein  46.92 
 
 
260 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157644  normal  0.0998357 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3646  putative lipoprotein  46.98 
 
 
264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.499343  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2179  putative lipoprotein  39.3 
 
 
253 aa  154  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.255362  normal  0.223351 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4613  hypothetical protein  27.57 
 
 
452 aa  61.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002699  hypothetical protein  29.03 
 
 
442 aa  55.8  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174036  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03285  hypothetical protein  26.77 
 
 
452 aa  50.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  26.69 
 
 
819 aa  50.1  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2678  hypothetical protein  32.35 
 
 
455 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176032  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3223  hypothetical protein  24.6 
 
 
469 aa  42  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>