35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1514 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1514  putative lipoprotein  100 
 
 
262 aa  517  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.918072  normal  0.757396 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2662  putative lipoprotein  75 
 
 
264 aa  401  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.524539 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1453  putative lipoprotein  73.86 
 
 
264 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.219204 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1347  putative lipoprotein  54.51 
 
 
322 aa  266  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2996  hypothetical protein  54.51 
 
 
328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3121  hypothetical protein  54.12 
 
 
328 aa  265  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.583766  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3946  hypothetical protein  53.33 
 
 
253 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.359138  normal  0.604331 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3439  hypothetical protein  52.55 
 
 
253 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.595275  normal  0.0623525 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2036  hypothetical protein  50.59 
 
 
254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103876  normal  0.167433 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4555  hypothetical protein  50 
 
 
255 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.587394 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3491  hypothetical protein  49.8 
 
 
253 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000451497 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4033  hypothetical protein  49.8 
 
 
253 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.26981  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4333  hypothetical protein  49.8 
 
 
253 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663508  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3890  hypothetical protein  47.27 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3778  hypothetical protein  47.27 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157644  normal  0.0998357 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3646  putative lipoprotein  47.62 
 
 
264 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.499343  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2179  putative lipoprotein  37.72 
 
 
253 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.255362  normal  0.223351 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2678  hypothetical protein  26.72 
 
 
455 aa  62  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176032  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4613  hypothetical protein  27.33 
 
 
452 aa  57  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2171  hypothetical protein  30.17 
 
 
217 aa  54.3  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.221923  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3050  hypothetical protein  27.35 
 
 
249 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2111  hypothetical protein  24.6 
 
 
249 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2274  hypothetical protein  26.91 
 
 
249 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2144  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.71 
 
 
261 aa  50.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.891643  hitchhiker  0.000531775 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002699  hypothetical protein  27.14 
 
 
442 aa  49.7  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174036  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2401  hypothetical protein  29.7 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  26.07 
 
 
819 aa  47.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2326  hypothetical protein  29.7 
 
 
249 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101216  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2138  hypothetical protein  27.72 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2317  hypothetical protein  27.72 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2292  hypothetical protein  27.72 
 
 
251 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2072  hypothetical protein  27.72 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.562023  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2076  hypothetical protein  27.72 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1389  hypothetical protein  23.68 
 
 
232 aa  42.7  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0507165 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2803  hypothetical protein  30.08 
 
 
715 aa  42.4  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.549688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>