31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3890 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_3778  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  518  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157644  normal  0.0998357 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3890  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  518  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4333  hypothetical protein  51.55 
 
 		 253 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663508  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4033  hypothetical protein  51.55 
 
 		 253 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3491  hypothetical protein  51.16 
 
 		 253 aa  245  6e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000451497 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4555  hypothetical protein  50 
 
 		 255 aa  241  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.587394 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3439  hypothetical protein  47.47 
 
 		 253 aa  232  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.595275  normal  0.0623525 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3946  hypothetical protein  47.47 
 
 		 253 aa  231  9e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.359138  normal  0.604331 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2036  hypothetical protein  47.29 
 
 		 254 aa  229  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103876  normal  0.167433 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1347  putative lipoprotein  45.7 
 
 		 322 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2996  hypothetical protein  45.7 
 
 		 328 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3121  hypothetical protein  45.7 
 
 		 328 aa  214  8e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.583766  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1514  putative lipoprotein  47.27 
 
 		 262 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.918072  normal  0.757396 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2662  putative lipoprotein  46.92 
 
 		 264 aa  202  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.524539 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3646  putative lipoprotein  47.81 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.499343  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1453  putative lipoprotein  46.54 
 
 		 264 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.219204 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2179  putative lipoprotein  38.91 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.255362  normal  0.223351 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  27.54 
 
 		 819 aa  62.4  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4613  hypothetical protein  26.98 
 
 		 452 aa  62.4  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2678  hypothetical protein  25.3 
 
 		 455 aa  56.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176032  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2144  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.18 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.891643  hitchhiker  0.000531775 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1378  hypothetical protein  27.66 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3223  hypothetical protein  33.62 
 
 		 469 aa  50.4  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002699  hypothetical protein  23.27 
 
 		 442 aa  49.7  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174036  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2803  hypothetical protein  30.77 
 
 		 715 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.549688  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3050  hypothetical protein  24.46 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2274  hypothetical protein  24.63 
 
 		 249 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2340  cell wall anchor domain-containing protein  27.91 
 
 		 259 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2111  hypothetical protein  24.63 
 
 		 249 aa  46.2  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2469  cell wall anchor domain-containing protein  27.91 
 
 		 259 aa  45.4  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1681  hypothetical protein  23.41 
 
 		 249 aa  42  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0618086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>