29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2179 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2179  putative lipoprotein  100 
 
 		 253 aa  501  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.255362  normal  0.223351 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4555  hypothetical protein  46.09 
 
 		 255 aa  209  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.587394 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3646  putative lipoprotein  46.09 
 
 		 264 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.499343  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3946  hypothetical protein  46.67 
 
 		 253 aa  204  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.359138  normal  0.604331 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3439  hypothetical protein  45.49 
 
 		 253 aa  201  9e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.595275  normal  0.0623525 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3491  hypothetical protein  45.1 
 
 		 253 aa  198  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000451497 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2036  hypothetical protein  43.53 
 
 		 254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103876  normal  0.167433 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4333  hypothetical protein  44.71 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663508  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4033  hypothetical protein  44.71 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2996  hypothetical protein  43.85 
 
 		 328 aa  194  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1347  putative lipoprotein  42.91 
 
 		 322 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3121  hypothetical protein  43.85 
 
 		 328 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.583766  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3890  hypothetical protein  38.61 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3778  hypothetical protein  38.61 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157644  normal  0.0998357 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2662  putative lipoprotein  39.53 
 
 		 264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.524539 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1453  putative lipoprotein  38.76 
 
 		 264 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.219204 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1514  putative lipoprotein  37.31 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.918072  normal  0.757396 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2144  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.95 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.891643  hitchhiker  0.000531775 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  28.38 
 
 		 819 aa  61.2  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4613  hypothetical protein  24.87 
 
 		 452 aa  56.6  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2678  hypothetical protein  28.97 
 
 		 455 aa  55.5  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176032  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3223  hypothetical protein  25.31 
 
 		 469 aa  55.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4137  hypothetical protein  28.02 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.257203 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2171  hypothetical protein  29.45 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.221923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03285  hypothetical protein  26.47 
 
 		 452 aa  45.8  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2340  cell wall anchor domain-containing protein  27.17 
 
 		 259 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5822  hypothetical protein  29.7 
 
 		 234 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679921  hitchhiker  0.00490429 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2469  cell wall anchor domain-containing protein  27.27 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2068  hypothetical protein  28.65 
 
 		 317 aa  42  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>