24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3491 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3491  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000451497 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4333  hypothetical protein  99.21 
 
 
253 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663508  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4033  hypothetical protein  99.21 
 
 
253 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.26981  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2036  hypothetical protein  89.37 
 
 
254 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103876  normal  0.167433 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3439  hypothetical protein  88.14 
 
 
253 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.595275  normal  0.0623525 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3946  hypothetical protein  87.35 
 
 
253 aa  454  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.359138  normal  0.604331 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4555  hypothetical protein  87.45 
 
 
255 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.587394 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1347  putative lipoprotein  76.28 
 
 
322 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2996  hypothetical protein  76.28 
 
 
328 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3121  hypothetical protein  75.89 
 
 
328 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.583766  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2662  putative lipoprotein  50.58 
 
 
264 aa  255  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.524539 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1453  putative lipoprotein  49.81 
 
 
264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.219204 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1514  putative lipoprotein  49.8 
 
 
262 aa  249  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.918072  normal  0.757396 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3778  hypothetical protein  51.16 
 
 
260 aa  245  6e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157644  normal  0.0998357 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3890  hypothetical protein  51.16 
 
 
260 aa  245  6e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3646  putative lipoprotein  47.58 
 
 
264 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.499343  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2179  putative lipoprotein  44.59 
 
 
253 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.255362  normal  0.223351 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4137  hypothetical protein  29.15 
 
 
240 aa  67  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.257203 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2678  hypothetical protein  26.29 
 
 
455 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176032  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002699  hypothetical protein  28.57 
 
 
442 aa  53.1  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174036  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  27.04 
 
 
819 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2171  hypothetical protein  30.71 
 
 
217 aa  47  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.221923  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3568  hypothetical protein  23.58 
 
 
456 aa  44.3  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000948267  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6256  hypothetical protein  24.02 
 
 
238 aa  43.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.25364  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>