58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2678 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2678  hypothetical protein  100 
 
 
455 aa  878    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176032  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  43.13 
 
 
819 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3223  hypothetical protein  39.83 
 
 
469 aa  256  6e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4613  hypothetical protein  37.47 
 
 
452 aa  242  9e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03285  hypothetical protein  34.82 
 
 
452 aa  209  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002699  hypothetical protein  34.7 
 
 
442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174036  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2803  hypothetical protein  31.83 
 
 
715 aa  124  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.549688  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2144  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  37.7 
 
 
261 aa  103  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.891643  hitchhiker  0.000531775 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2340  cell wall anchor domain-containing protein  42.5 
 
 
259 aa  93.2  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2469  cell wall anchor domain-containing protein  34.15 
 
 
259 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2171  hypothetical protein  36.36 
 
 
217 aa  83.2  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.221923  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1378  hypothetical protein  38.52 
 
 
273 aa  72  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0598  hypothetical protein  34.01 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2068  hypothetical protein  33.49 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270078  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0999  cell wall anchor domain-containing protein  34.05 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000353845  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3646  putative lipoprotein  32.66 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.499343  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2274  hypothetical protein  26.32 
 
 
249 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3050  hypothetical protein  26.32 
 
 
249 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1325  hypothetical protein  33.95 
 
 
351 aa  65.1  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.213882  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2401  hypothetical protein  25 
 
 
249 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2111  hypothetical protein  25 
 
 
249 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1514  putative lipoprotein  26.72 
 
 
262 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.918072  normal  0.757396 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2326  hypothetical protein  25 
 
 
249 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101216  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2317  hypothetical protein  24.34 
 
 
249 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2138  hypothetical protein  24.34 
 
 
249 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2292  hypothetical protein  24.34 
 
 
251 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2076  hypothetical protein  24.34 
 
 
249 aa  61.2  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2573  hypothetical protein  25.73 
 
 
217 aa  60.8  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2072  hypothetical protein  23.68 
 
 
249 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.562023  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2996  hypothetical protein  24.67 
 
 
328 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3121  hypothetical protein  24.67 
 
 
328 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.583766  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1347  putative lipoprotein  24.67 
 
 
322 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3778  hypothetical protein  26.07 
 
 
260 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157644  normal  0.0998357 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3890  hypothetical protein  26.07 
 
 
260 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5822  hypothetical protein  29.7 
 
 
234 aa  57  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679921  hitchhiker  0.00490429 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2036  hypothetical protein  25.1 
 
 
254 aa  57  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103876  normal  0.167433 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3491  hypothetical protein  25.6 
 
 
253 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000451497 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05210  hypothetical protein  33.05 
 
 
207 aa  56.6  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.193407  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4555  hypothetical protein  25 
 
 
255 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.587394 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4333  hypothetical protein  25.2 
 
 
253 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663508  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4033  hypothetical protein  25.2 
 
 
253 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.26981  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1681  hypothetical protein  24.34 
 
 
249 aa  54.7  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0618086  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2179  putative lipoprotein  31.25 
 
 
253 aa  54.3  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.255362  normal  0.223351 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3473  lipoprotein  35.71 
 
 
273 aa  52.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1389  hypothetical protein  28.75 
 
 
232 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0507165 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3946  hypothetical protein  24.56 
 
 
253 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.359138  normal  0.604331 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1089  hypothetical protein  28.82 
 
 
359 aa  50.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3439  hypothetical protein  25 
 
 
253 aa  50.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.595275  normal  0.0623525 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0475  lipoprotein  33.33 
 
 
279 aa  49.7  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.786291  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3585  hypothetical protein  24.58 
 
 
457 aa  47  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3055  lipoprotein  30.77 
 
 
235 aa  46.6  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1453  putative lipoprotein  27.35 
 
 
264 aa  47  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.219204 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4137  hypothetical protein  27.56 
 
 
240 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.257203 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0372  lipoprotein  31.48 
 
 
277 aa  44.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0725  hypothetical protein  36.71 
 
 
423 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2662  putative lipoprotein  32.35 
 
 
264 aa  44.3  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.524539 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1854  hypothetical protein  21.38 
 
 
456 aa  43.5  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000041317  unclonable  0.00000314319 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3105  hypothetical protein  38.2 
 
 
280 aa  43.1  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.58027  normal  0.0277441 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>