48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4613 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4613  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  892    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  40.75 
 
 		 819 aa  290  5.0000000000000004e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3223  hypothetical protein  41.19 
 
 		 469 aa  271  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2678  hypothetical protein  37.87 
 
 		 455 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176032  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03285  hypothetical protein  34.51 
 
 		 452 aa  207  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002699  hypothetical protein  34.66 
 
 		 442 aa  206  5e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174036  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2803  hypothetical protein  30.7 
 
 		 715 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.549688  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2469  cell wall anchor domain-containing protein  33.68 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2144  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  34.41 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.891643  hitchhiker  0.000531775 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2340  cell wall anchor domain-containing protein  32.45 
 
 		 259 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2171  hypothetical protein  31.53 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.221923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0999  cell wall anchor domain-containing protein  27.75 
 
 		 224 aa  68.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000353845  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3890  hypothetical protein  26.98 
 
 		 260 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3778  hypothetical protein  26.98 
 
 		 260 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157644  normal  0.0998357 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2068  hypothetical protein  31 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270078  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1453  putative lipoprotein  27.57 
 
 		 264 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.219204 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3646  putative lipoprotein  27.23 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.499343  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2662  putative lipoprotein  27.57 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.524539 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0598  hypothetical protein  26.84 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2179  putative lipoprotein  25.91 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.255362  normal  0.223351 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1514  putative lipoprotein  25.33 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.918072  normal  0.757396 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0708  hypothetical protein  21.66 
 
 		 455 aa  56.2  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000336501  decreased coverage  0.0000114896 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1325  hypothetical protein  28.21 
 
 		 351 aa  52.8  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.213882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2274  hypothetical protein  21.47 
 
 		 249 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1378  hypothetical protein  28.43 
 
 		 273 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4555  hypothetical protein  26.34 
 
 		 255 aa  52.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.587394 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3050  hypothetical protein  20.94 
 
 		 249 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2111  hypothetical protein  20.94 
 
 		 249 aa  51.2  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3055  lipoprotein  34.26 
 
 		 235 aa  50.1  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5822  hypothetical protein  25.54 
 
 		 234 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679921  hitchhiker  0.00490429 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3720  hypothetical protein  22.95 
 
 		 455 aa  48.5  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000107792  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3946  hypothetical protein  24.29 
 
 		 253 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.359138  normal  0.604331 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4033  hypothetical protein  23.87 
 
 		 253 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4333  hypothetical protein  23.87 
 
 		 253 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663508  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2401  hypothetical protein  20.11 
 
 		 249 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3491  hypothetical protein  23.42 
 
 		 253 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000451497 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2036  hypothetical protein  23.01 
 
 		 254 aa  45.8  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103876  normal  0.167433 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2326  hypothetical protein  21.99 
 
 		 249 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101216  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05210  hypothetical protein  23.76 
 
 		 207 aa  44.3  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.193407  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2138  hypothetical protein  19.05 
 
 		 249 aa  43.9  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2317  hypothetical protein  19.05 
 
 		 249 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3439  hypothetical protein  23.72 
 
 		 253 aa  43.9  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.595275  normal  0.0623525 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2076  hypothetical protein  19.05 
 
 		 249 aa  43.9  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2292  hypothetical protein  19.05 
 
 		 251 aa  43.9  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1389  hypothetical protein  32.76 
 
 		 232 aa  43.5  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0507165 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2996  hypothetical protein  22.94 
 
 		 328 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3121  hypothetical protein  22.94 
 
 		 328 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.583766  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1347  putative lipoprotein  22.94 
 
 		 322 aa  43.5  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>