21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0475 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0475  lipoprotein  100 
 
 
279 aa  526  1e-148  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.786291  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3473  lipoprotein  77.4 
 
 
273 aa  285  5e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0372  lipoprotein  69.23 
 
 
277 aa  256  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0220  lipoprotein  65.16 
 
 
277 aa  245  6e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3055  lipoprotein  68.04 
 
 
235 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3257  lipoprotein  67.36 
 
 
235 aa  242  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0735939  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4205  hypothetical protein  53.52 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.548465 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3105  hypothetical protein  54.15 
 
 
280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.58027  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4635  hypothetical protein  45.31 
 
 
276 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.616859  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4658  hypothetical protein  55.67 
 
 
269 aa  179  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2642  hypothetical protein  35.98 
 
 
240 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0107943  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1578  hypothetical protein  34.86 
 
 
240 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000507242  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2144  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  36.36 
 
 
261 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.891643  hitchhiker  0.000531775 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2340  cell wall anchor domain-containing protein  33.95 
 
 
259 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0999  cell wall anchor domain-containing protein  33.52 
 
 
224 aa  58.9  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000353845  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2469  cell wall anchor domain-containing protein  31.44 
 
 
259 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2678  hypothetical protein  35.25 
 
 
455 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176032  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1378  hypothetical protein  36.15 
 
 
273 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2803  hypothetical protein  34.62 
 
 
715 aa  45.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.549688  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0598  hypothetical protein  34.62 
 
 
263 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1325  hypothetical protein  32.84 
 
 
351 aa  42.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.213882  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>