20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0372 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0372  lipoprotein  100 
 
 
277 aa  527  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0220  lipoprotein  82.91 
 
 
277 aa  356  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0475  lipoprotein  62.06 
 
 
279 aa  278  8e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.786291  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3055  lipoprotein  73.06 
 
 
235 aa  257  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3473  lipoprotein  72.64 
 
 
273 aa  254  7e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3257  lipoprotein  71.35 
 
 
235 aa  249  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0735939  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4205  hypothetical protein  49.52 
 
 
276 aa  190  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.548465 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4658  hypothetical protein  54.5 
 
 
269 aa  178  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3105  hypothetical protein  50.72 
 
 
280 aa  176  5e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.58027  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4635  hypothetical protein  43.58 
 
 
276 aa  159  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.616859  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2642  hypothetical protein  37.56 
 
 
240 aa  95.5  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0107943  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1578  hypothetical protein  36.32 
 
 
240 aa  93.2  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000507242  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2340  cell wall anchor domain-containing protein  34.92 
 
 
259 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2469  cell wall anchor domain-containing protein  34.85 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2144  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  33.67 
 
 
261 aa  63.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.891643  hitchhiker  0.000531775 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2803  hypothetical protein  33.68 
 
 
715 aa  55.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.549688  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2678  hypothetical protein  31.02 
 
 
455 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176032  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0999  cell wall anchor domain-containing protein  30.49 
 
 
224 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000353845  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0598  hypothetical protein  30.72 
 
 
263 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1378  hypothetical protein  33.33 
 
 
273 aa  42.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>