20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3257 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3257  lipoprotein  100 
 
 
235 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0735939  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3055  lipoprotein  88.94 
 
 
235 aa  380  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0372  lipoprotein  71.35 
 
 
277 aa  235  5.0000000000000005e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0475  lipoprotein  62.67 
 
 
279 aa  234  6e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.786291  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3473  lipoprotein  66.84 
 
 
273 aa  228  6e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0220  lipoprotein  68.21 
 
 
277 aa  226  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3105  hypothetical protein  51.32 
 
 
280 aa  168  8e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.58027  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4658  hypothetical protein  51.05 
 
 
269 aa  161  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4205  hypothetical protein  46.56 
 
 
276 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.548465 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4635  hypothetical protein  41.94 
 
 
276 aa  133  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.616859  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1578  hypothetical protein  37.96 
 
 
240 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000507242  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2642  hypothetical protein  36.87 
 
 
240 aa  99  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0107943  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2340  cell wall anchor domain-containing protein  31.75 
 
 
259 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2469  cell wall anchor domain-containing protein  31.22 
 
 
259 aa  55.1  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2144  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.81 
 
 
261 aa  51.2  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.891643  hitchhiker  0.000531775 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1378  hypothetical protein  33.14 
 
 
273 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2803  hypothetical protein  32.28 
 
 
715 aa  48.9  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.549688  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2068  hypothetical protein  30.49 
 
 
317 aa  46.6  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270078  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0598  hypothetical protein  32 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4613  hypothetical protein  30.87 
 
 
452 aa  42  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>