17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4635 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4635  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  543  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.616859  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4205  hypothetical protein  75.36 
 
 
276 aa  344  7e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.548465 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3105  hypothetical protein  48 
 
 
280 aa  179  5.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.58027  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0475  lipoprotein  45.31 
 
 
279 aa  177  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.786291  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4658  hypothetical protein  50.25 
 
 
269 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3473  lipoprotein  46.57 
 
 
273 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0372  lipoprotein  42.74 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0220  lipoprotein  43.4 
 
 
277 aa  145  8.000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3257  lipoprotein  42.41 
 
 
235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0735939  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3055  lipoprotein  41.97 
 
 
235 aa  128  9.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2642  hypothetical protein  37.96 
 
 
240 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0107943  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1578  hypothetical protein  36.5 
 
 
240 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000507242  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1378  hypothetical protein  31.89 
 
 
273 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2469  cell wall anchor domain-containing protein  31.35 
 
 
259 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0999  cell wall anchor domain-containing protein  28.72 
 
 
224 aa  46.6  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000353845  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2340  cell wall anchor domain-containing protein  30.05 
 
 
259 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2144  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  29.19 
 
 
261 aa  42.7  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.891643  hitchhiker  0.000531775 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>