55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2469 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2469  cell wall anchor domain-containing protein  100 
 
 		 259 aa  499  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2340  cell wall anchor domain-containing protein  90.73 
 
 		 259 aa  409  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2144  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  65.56 
 
 		 261 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.891643  hitchhiker  0.000531775 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2171  hypothetical protein  45.75 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.221923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0999  cell wall anchor domain-containing protein  43.09 
 
 		 224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000353845  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1389  hypothetical protein  41.06 
 
 		 232 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0507165 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0598  hypothetical protein  43.33 
 
 		 263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3050  hypothetical protein  35.03 
 
 		 249 aa  119  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2068  hypothetical protein  41.23 
 
 		 317 aa  119  7e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270078  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2274  hypothetical protein  35.03 
 
 		 249 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2111  hypothetical protein  30.94 
 
 		 249 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2401  hypothetical protein  34.46 
 
 		 249 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2326  hypothetical protein  34.46 
 
 		 249 aa  116  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101216  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2138  hypothetical protein  30.62 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2317  hypothetical protein  30.62 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2803  hypothetical protein  37.98 
 
 		 715 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.549688  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2292  hypothetical protein  30.62 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2076  hypothetical protein  30.62 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2072  hypothetical protein  29.67 
 
 		 249 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.562023  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1378  hypothetical protein  41.94 
 
 		 273 aa  106  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1325  hypothetical protein  34.1 
 
 		 351 aa  105  6e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.213882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1681  hypothetical protein  30.29 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0618086  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4116  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  36.36 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05210  hypothetical protein  31.11 
 
 		 207 aa  94.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.193407  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2678  hypothetical protein  41.67 
 
 		 455 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176032  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2451  hypothetical protein  30.69 
 
 		 238 aa  86.7  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.650531 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  31.56 
 
 		 819 aa  85.9  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5822  hypothetical protein  36.02 
 
 		 234 aa  85.5  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679921  hitchhiker  0.00490429 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4613  hypothetical protein  33.68 
 
 		 452 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002699  hypothetical protein  31.82 
 
 		 442 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174036  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2573  hypothetical protein  26.88 
 
 		 217 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3757  hypothetical protein  27.68 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0626654  normal  0.0846968 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03285  hypothetical protein  30.19 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0053  hypothetical protein  28.79 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.935944  normal  0.582705 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0725  hypothetical protein  29.13 
 
 		 423 aa  70.1  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3223  hypothetical protein  30.89 
 
 		 469 aa  67  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4205  hypothetical protein  31.88 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.548465 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3234  hypothetical protein  31.22 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.12009 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3055  lipoprotein  33.51 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0372  lipoprotein  34.52 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3105  hypothetical protein  34.22 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.58027  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1089  hypothetical protein  26.61 
 
 		 359 aa  55.8  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0475  lipoprotein  31.25 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.786291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3257  lipoprotein  31.12 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0735939  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4635  hypothetical protein  30.23 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.616859  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4658  hypothetical protein  34.62 
 
 		 269 aa  52.4  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0220  lipoprotein  33.67 
 
 		 277 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3646  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 264 aa  49.7  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.499343  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3473  lipoprotein  31.61 
 
 		 273 aa  48.9  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4137  hypothetical protein  26.75 
 
 		 240 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.257203 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3890  hypothetical protein  27.33 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3778  hypothetical protein  27.33 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157644  normal  0.0998357 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2179  putative lipoprotein  27.27 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.255362  normal  0.223351 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2642  hypothetical protein  31.55 
 
 		 240 aa  42.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0107943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4129  hypothetical protein  30.84 
 
 		 265 aa  42.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0991199  normal  0.946637 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>