14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2451 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2451  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  473  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.650531 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0053  hypothetical protein  29.86 
 
 
235 aa  84.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.935944  normal  0.582705 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2340  cell wall anchor domain-containing protein  30.73 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2469  cell wall anchor domain-containing protein  29.89 
 
 
259 aa  82  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5822  hypothetical protein  30.96 
 
 
234 aa  77.8  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679921  hitchhiker  0.00490429 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2144  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.5 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.891643  hitchhiker  0.000531775 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2171  hypothetical protein  29.33 
 
 
217 aa  62.4  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.221923  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2803  hypothetical protein  25.12 
 
 
715 aa  57.8  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.549688  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2573  hypothetical protein  23.9 
 
 
217 aa  54.3  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05210  hypothetical protein  23.63 
 
 
207 aa  53.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.193407  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1389  hypothetical protein  24.23 
 
 
232 aa  52  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0507165 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1378  hypothetical protein  21.59 
 
 
273 aa  48.9  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1325  hypothetical protein  24.35 
 
 
351 aa  46.6  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.213882  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2068  hypothetical protein  21.71 
 
 
317 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>