38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5822 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5822  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  463  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679921  hitchhiker  0.00490429 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2144  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  35.75 
 
 		 261 aa  89.7  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.891643  hitchhiker  0.000531775 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0598  hypothetical protein  31.66 
 
 		 263 aa  88.6  8e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0053  hypothetical protein  30.24 
 
 		 235 aa  85.5  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.935944  normal  0.582705 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2451  hypothetical protein  31.63 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.650531 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2469  cell wall anchor domain-containing protein  36.02 
 
 		 259 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1389  hypothetical protein  31.31 
 
 		 232 aa  81.6  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0507165 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2171  hypothetical protein  31.49 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.221923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2340  cell wall anchor domain-containing protein  34.38 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05210  hypothetical protein  28.09 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.193407  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1378  hypothetical protein  27.04 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2068  hypothetical protein  29.6 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270078  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3050  hypothetical protein  26.63 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2111  hypothetical protein  26.77 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2317  hypothetical protein  26.79 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2076  hypothetical protein  26.79 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2138  hypothetical protein  26.79 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2292  hypothetical protein  26.79 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2274  hypothetical protein  27.27 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2072  hypothetical protein  26.32 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.562023  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2803  hypothetical protein  26.84 
 
 		 715 aa  64.7  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.549688  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2326  hypothetical protein  26.32 
 
 		 249 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2401  hypothetical protein  27.17 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0999  cell wall anchor domain-containing protein  26.88 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000353845  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1325  hypothetical protein  27.42 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.213882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1681  hypothetical protein  23.2 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0618086  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0348  hypothetical protein  26.48 
 
 		 270 aa  55.1  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3757  hypothetical protein  25.25 
 
 		 292 aa  53.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0626654  normal  0.0846968 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2678  hypothetical protein  29.7 
 
 		 455 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176032  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3234  hypothetical protein  27.45 
 
 		 229 aa  49.7  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.12009 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  35.16 
 
 		 819 aa  49.7  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2573  hypothetical protein  29.63 
 
 		 217 aa  49.3  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4613  hypothetical protein  26.18 
 
 		 452 aa  49.3  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0346  hypothetical protein  25.77 
 
 		 271 aa  47.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2179  putative lipoprotein  29.76 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.255362  normal  0.223351 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3223  hypothetical protein  26.77 
 
 		 469 aa  45.4  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4116  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.13 
 
 		 299 aa  43.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6256  hypothetical protein  22.79 
 
 		 238 aa  42.4  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.25364  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>