49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2171 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2171  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  429  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.221923  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1389  hypothetical protein  42.86 
 
 
232 aa  164  8e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0507165 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2469  cell wall anchor domain-containing protein  47.92 
 
 
259 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2340  cell wall anchor domain-containing protein  46.03 
 
 
259 aa  150  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2144  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  43.59 
 
 
261 aa  147  9e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.891643  hitchhiker  0.000531775 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0598  hypothetical protein  38.29 
 
 
263 aa  104  8e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2803  hypothetical protein  39.58 
 
 
715 aa  97.1  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.549688  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2111  hypothetical protein  28.84 
 
 
249 aa  95.5  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2068  hypothetical protein  37.7 
 
 
317 aa  95.1  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270078  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3050  hypothetical protein  28.37 
 
 
249 aa  95.1  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2274  hypothetical protein  27.91 
 
 
249 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2401  hypothetical protein  28.37 
 
 
249 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2326  hypothetical protein  28.37 
 
 
249 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101216  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2138  hypothetical protein  27.91 
 
 
249 aa  91.3  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1378  hypothetical protein  35.58 
 
 
273 aa  90.9  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2317  hypothetical protein  27.91 
 
 
249 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2076  hypothetical protein  27.91 
 
 
249 aa  91.3  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2292  hypothetical protein  27.91 
 
 
251 aa  91.3  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0999  cell wall anchor domain-containing protein  33.67 
 
 
224 aa  89.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000353845  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1325  hypothetical protein  32.69 
 
 
351 aa  89.4  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.213882  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2072  hypothetical protein  26.51 
 
 
249 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.562023  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2678  hypothetical protein  36.36 
 
 
455 aa  82.8  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176032  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4116  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.33 
 
 
299 aa  81.6  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2573  hypothetical protein  27.33 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5822  hypothetical protein  31.49 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679921  hitchhiker  0.00490429 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1681  hypothetical protein  27.5 
 
 
249 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0618086  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05210  hypothetical protein  27.18 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.193407  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4613  hypothetical protein  31.53 
 
 
452 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  27.41 
 
 
819 aa  65.9  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1089  hypothetical protein  28.04 
 
 
359 aa  62.8  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2451  hypothetical protein  29.33 
 
 
238 aa  62.4  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.650531 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3223  hypothetical protein  27.66 
 
 
469 aa  55.8  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0725  hypothetical protein  48.33 
 
 
423 aa  54.7  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1514  putative lipoprotein  30.17 
 
 
262 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.918072  normal  0.757396 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002699  hypothetical protein  36.94 
 
 
442 aa  52.4  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174036  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0053  hypothetical protein  25.7 
 
 
235 aa  51.2  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.935944  normal  0.582705 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03285  hypothetical protein  33.94 
 
 
452 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3491  hypothetical protein  30.71 
 
 
253 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000451497 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2179  putative lipoprotein  30.49 
 
 
253 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.255362  normal  0.223351 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4333  hypothetical protein  30.71 
 
 
253 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663508  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4033  hypothetical protein  30.71 
 
 
253 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.26981  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4137  hypothetical protein  29.03 
 
 
240 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.257203 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3946  hypothetical protein  28.57 
 
 
253 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.359138  normal  0.604331 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3121  hypothetical protein  30.97 
 
 
328 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.583766  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4555  hypothetical protein  30.09 
 
 
255 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.587394 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1347  putative lipoprotein  30.97 
 
 
322 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2996  hypothetical protein  30.97 
 
 
328 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3439  hypothetical protein  27.73 
 
 
253 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.595275  normal  0.0623525 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1453  putative lipoprotein  28.81 
 
 
264 aa  42.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.219204 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>