54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2340 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2340  cell wall anchor domain-containing protein  100 
 
 
259 aa  503  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2469  cell wall anchor domain-containing protein  90.73 
 
 
259 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2144  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  66.95 
 
 
261 aa  284  9e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.891643  hitchhiker  0.000531775 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2171  hypothetical protein  44.55 
 
 
217 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.221923  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0999  cell wall anchor domain-containing protein  42.94 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000353845  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2068  hypothetical protein  41.23 
 
 
317 aa  120  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270078  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0598  hypothetical protein  43.89 
 
 
263 aa  118  7.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1389  hypothetical protein  38.67 
 
 
232 aa  116  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0507165 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2803  hypothetical protein  37.44 
 
 
715 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.549688  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3050  hypothetical protein  32.54 
 
 
249 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2274  hypothetical protein  32.06 
 
 
249 aa  113  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2111  hypothetical protein  31.1 
 
 
249 aa  112  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2326  hypothetical protein  32.77 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2401  hypothetical protein  32.77 
 
 
249 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2138  hypothetical protein  30.62 
 
 
249 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2317  hypothetical protein  30.62 
 
 
249 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2292  hypothetical protein  30.62 
 
 
251 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2076  hypothetical protein  30.62 
 
 
249 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2072  hypothetical protein  28.23 
 
 
249 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.562023  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1378  hypothetical protein  41.27 
 
 
273 aa  106  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1325  hypothetical protein  37.16 
 
 
351 aa  99.4  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.213882  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1681  hypothetical protein  28.26 
 
 
249 aa  96.7  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0618086  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4116  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  35.22 
 
 
299 aa  94.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2678  hypothetical protein  42.5 
 
 
455 aa  93.2  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176032  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05210  hypothetical protein  29.79 
 
 
207 aa  92  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.193407  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2451  hypothetical protein  31.22 
 
 
238 aa  86.3  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.650531 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2573  hypothetical protein  26.58 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5822  hypothetical protein  34.38 
 
 
234 aa  79.3  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679921  hitchhiker  0.00490429 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  31.75 
 
 
819 aa  78.6  0.00000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4613  hypothetical protein  32.45 
 
 
452 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3757  hypothetical protein  29.09 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0626654  normal  0.0846968 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002699  hypothetical protein  31.53 
 
 
442 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174036  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0053  hypothetical protein  29.19 
 
 
235 aa  69.3  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.935944  normal  0.582705 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4205  hypothetical protein  31.8 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.548465 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3223  hypothetical protein  31.96 
 
 
469 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0725  hypothetical protein  28.23 
 
 
423 aa  67.4  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03285  hypothetical protein  32.49 
 
 
452 aa  67  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3055  lipoprotein  34.03 
 
 
235 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0475  lipoprotein  33.71 
 
 
279 aa  63.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.786291  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0372  lipoprotein  34.9 
 
 
277 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3105  hypothetical protein  34.39 
 
 
280 aa  60.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.58027  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3234  hypothetical protein  30 
 
 
229 aa  60.1  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.12009 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3257  lipoprotein  32.14 
 
 
235 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0735939  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1089  hypothetical protein  27.73 
 
 
359 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4635  hypothetical protein  30.23 
 
 
276 aa  53.1  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.616859  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4658  hypothetical protein  34.07 
 
 
269 aa  53.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4137  hypothetical protein  27.6 
 
 
240 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.257203 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0220  lipoprotein  33.01 
 
 
277 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3646  putative lipoprotein  28.32 
 
 
264 aa  50.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.499343  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3778  hypothetical protein  27.36 
 
 
260 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157644  normal  0.0998357 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3890  hypothetical protein  27.36 
 
 
260 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3473  lipoprotein  31.09 
 
 
273 aa  48.5  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2179  putative lipoprotein  27.32 
 
 
253 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.255362  normal  0.223351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1578  hypothetical protein  31.34 
 
 
240 aa  42.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000507242  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>