22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4205 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_4205  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  537  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.548465 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4635  hypothetical protein  75.36 
 
 
276 aa  404  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.616859  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3105  hypothetical protein  53.78 
 
 
280 aa  216  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.58027  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0475  lipoprotein  50.61 
 
 
279 aa  207  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.786291  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4658  hypothetical protein  55.17 
 
 
269 aa  199  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3473  lipoprotein  53.92 
 
 
273 aa  192  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0372  lipoprotein  50.24 
 
 
277 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0220  lipoprotein  49.05 
 
 
277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3055  lipoprotein  46.63 
 
 
235 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3257  lipoprotein  46.6 
 
 
235 aa  145  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0735939  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2642  hypothetical protein  32.71 
 
 
240 aa  82.8  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0107943  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1578  hypothetical protein  30.88 
 
 
240 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000507242  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2340  cell wall anchor domain-containing protein  32.11 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2469  cell wall anchor domain-containing protein  33.33 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2144  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.97 
 
 
261 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.891643  hitchhiker  0.000531775 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0999  cell wall anchor domain-containing protein  30.1 
 
 
224 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000353845  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1325  hypothetical protein  31.5 
 
 
351 aa  46.2  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.213882  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1378  hypothetical protein  34.13 
 
 
273 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0598  hypothetical protein  29.09 
 
 
263 aa  42.7  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2401  hypothetical protein  23.4 
 
 
249 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2803  hypothetical protein  31.82 
 
 
715 aa  42.4  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.549688  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2326  hypothetical protein  23.4 
 
 
249 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>