28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0053 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0053  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  475  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.935944  normal  0.582705 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2451  hypothetical protein  29.86 
 
 
238 aa  84.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.650531 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5822  hypothetical protein  29.76 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679921  hitchhiker  0.00490429 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2469  cell wall anchor domain-containing protein  28.65 
 
 
259 aa  68.9  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2340  cell wall anchor domain-containing protein  29.19 
 
 
259 aa  68.9  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2144  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.23 
 
 
261 aa  67  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.891643  hitchhiker  0.000531775 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1681  hypothetical protein  27.46 
 
 
249 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0618086  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2111  hypothetical protein  27.4 
 
 
249 aa  59.7  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2274  hypothetical protein  26.57 
 
 
249 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3050  hypothetical protein  26.44 
 
 
249 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2326  hypothetical protein  25.73 
 
 
249 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2401  hypothetical protein  27.27 
 
 
249 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2072  hypothetical protein  26.09 
 
 
249 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.562023  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2138  hypothetical protein  26.09 
 
 
249 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2317  hypothetical protein  26.09 
 
 
249 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2076  hypothetical protein  26.09 
 
 
249 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2292  hypothetical protein  26.09 
 
 
251 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1378  hypothetical protein  26.67 
 
 
273 aa  55.1  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0598  hypothetical protein  26.42 
 
 
263 aa  54.3  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2171  hypothetical protein  25.7 
 
 
217 aa  51.2  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.221923  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0348  hypothetical protein  25.42 
 
 
270 aa  48.9  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2803  hypothetical protein  32.63 
 
 
715 aa  48.5  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.549688  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0346  hypothetical protein  26.17 
 
 
271 aa  47.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1325  hypothetical protein  26.4 
 
 
351 aa  45.8  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.213882  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0999  cell wall anchor domain-containing protein  28.72 
 
 
224 aa  45.4  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000353845  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1389  hypothetical protein  31.09 
 
 
232 aa  43.1  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0507165 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3757  hypothetical protein  25.21 
 
 
292 aa  42.4  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0626654  normal  0.0846968 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1089  hypothetical protein  25.81 
 
 
359 aa  42  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>