32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3646 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3646  putative lipoprotein  100 
 
 		 264 aa  532  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.499343  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4555  hypothetical protein  46.74 
 
 		 255 aa  235  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.587394 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3946  hypothetical protein  46.74 
 
 		 253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.359138  normal  0.604331 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3439  hypothetical protein  46.74 
 
 		 253 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.595275  normal  0.0623525 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3491  hypothetical protein  45.98 
 
 		 253 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000451497 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4333  hypothetical protein  45.98 
 
 		 253 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663508  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4033  hypothetical protein  45.98 
 
 		 253 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2036  hypothetical protein  45.59 
 
 		 254 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103876  normal  0.167433 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3121  hypothetical protein  47.58 
 
 		 328 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.583766  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2996  hypothetical protein  47.18 
 
 		 328 aa  222  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1347  putative lipoprotein  47.18 
 
 		 322 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1514  putative lipoprotein  46.9 
 
 		 262 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.918072  normal  0.757396 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3890  hypothetical protein  46.67 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3778  hypothetical protein  46.67 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157644  normal  0.0998357 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2662  putative lipoprotein  48.41 
 
 		 264 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.524539 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1453  putative lipoprotein  46.36 
 
 		 264 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.219204 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2179  putative lipoprotein  46.26 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.255362  normal  0.223351 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  31.02 
 
 		 819 aa  72  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2678  hypothetical protein  30.47 
 
 		 455 aa  66.6  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176032  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4613  hypothetical protein  28.69 
 
 		 452 aa  64.7  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002699  hypothetical protein  23.97 
 
 		 442 aa  52.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174036  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3223  hypothetical protein  26.06 
 
 		 469 aa  52  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2340  cell wall anchor domain-containing protein  28.32 
 
 		 259 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2469  cell wall anchor domain-containing protein  28.57 
 
 		 259 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2144  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30.46 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.891643  hitchhiker  0.000531775 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2803  hypothetical protein  28.34 
 
 		 715 aa  48.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.549688  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03285  hypothetical protein  24.3 
 
 		 452 aa  47.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2068  hypothetical protein  29.28 
 
 		 317 aa  45.8  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270078  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1378  hypothetical protein  30.89 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3050  hypothetical protein  25.67 
 
 		 249 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2274  hypothetical protein  25.67 
 
 		 249 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0598  hypothetical protein  27.96 
 
 		 263 aa  42.4  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>