41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002699 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002699  hypothetical protein  100 
 
 
442 aa  863    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174036  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03285  hypothetical protein  84.39 
 
 
452 aa  738    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  39.69 
 
 
819 aa  221  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4613  hypothetical protein  34.66 
 
 
452 aa  195  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2678  hypothetical protein  34.47 
 
 
455 aa  190  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176032  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3223  hypothetical protein  33.05 
 
 
469 aa  187  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2803  hypothetical protein  28.26 
 
 
715 aa  80.5  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.549688  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2469  cell wall anchor domain-containing protein  32.08 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2144  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30.74 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.891643  hitchhiker  0.000531775 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2340  cell wall anchor domain-containing protein  32.31 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2068  hypothetical protein  33.88 
 
 
317 aa  61.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270078  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0598  hypothetical protein  29.02 
 
 
263 aa  59.7  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2326  hypothetical protein  25.43 
 
 
249 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2401  hypothetical protein  23.04 
 
 
249 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05210  hypothetical protein  24.88 
 
 
207 aa  57  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.193407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3050  hypothetical protein  22.63 
 
 
249 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3946  hypothetical protein  26.94 
 
 
253 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.359138  normal  0.604331 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1453  putative lipoprotein  29.03 
 
 
264 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.219204 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2662  putative lipoprotein  29.03 
 
 
264 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.524539 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2274  hypothetical protein  23 
 
 
249 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2111  hypothetical protein  22.63 
 
 
249 aa  54.3  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4033  hypothetical protein  28.57 
 
 
253 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.26981  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3439  hypothetical protein  26.94 
 
 
253 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.595275  normal  0.0623525 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4555  hypothetical protein  27.91 
 
 
255 aa  52.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.587394 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4333  hypothetical protein  28.57 
 
 
253 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663508  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3491  hypothetical protein  28.57 
 
 
253 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000451497 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2072  hypothetical protein  23.7 
 
 
249 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.562023  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2171  hypothetical protein  36.94 
 
 
217 aa  52.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.221923  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2317  hypothetical protein  24.38 
 
 
249 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2292  hypothetical protein  24.38 
 
 
251 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3646  putative lipoprotein  28.92 
 
 
264 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.499343  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2076  hypothetical protein  24.38 
 
 
249 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2138  hypothetical protein  24.38 
 
 
249 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2036  hypothetical protein  26.36 
 
 
254 aa  51.6  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103876  normal  0.167433 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3778  hypothetical protein  23.27 
 
 
260 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157644  normal  0.0998357 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1514  putative lipoprotein  27.14 
 
 
262 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.918072  normal  0.757396 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3890  hypothetical protein  23.27 
 
 
260 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1378  hypothetical protein  29.41 
 
 
273 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1089  hypothetical protein  25.85 
 
 
359 aa  44.3  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1325  hypothetical protein  25.62 
 
 
351 aa  43.9  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.213882  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0999  cell wall anchor domain-containing protein  26.67 
 
 
224 aa  43.1  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000353845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>