35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3223 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3223  hypothetical protein  100 
 
 		 469 aa  928    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  44.64 
 
 		 819 aa  311  2e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4613  hypothetical protein  41.19 
 
 		 452 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2678  hypothetical protein  39.31 
 
 		 455 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176032  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03285  hypothetical protein  33.19 
 
 		 452 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002699  hypothetical protein  33.05 
 
 		 442 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174036  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2803  hypothetical protein  30.25 
 
 		 715 aa  105  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.549688  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2068  hypothetical protein  31.79 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270078  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3050  hypothetical protein  29.61 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2274  hypothetical protein  29.61 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2111  hypothetical protein  29.61 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2326  hypothetical protein  27.68 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2401  hypothetical protein  27.68 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2138  hypothetical protein  27.12 
 
 		 249 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2317  hypothetical protein  27.12 
 
 		 249 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2076  hypothetical protein  27.12 
 
 		 249 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2292  hypothetical protein  27.12 
 
 		 251 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2072  hypothetical protein  29.05 
 
 		 249 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.562023  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2340  cell wall anchor domain-containing protein  32.29 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0598  hypothetical protein  29.19 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2144  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30.89 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.891643  hitchhiker  0.000531775 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2469  cell wall anchor domain-containing protein  30.89 
 
 		 259 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1378  hypothetical protein  35.21 
 
 		 273 aa  63.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1681  hypothetical protein  25.93 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0618086  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2573  hypothetical protein  23.56 
 
 		 217 aa  56.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2171  hypothetical protein  27.66 
 
 		 217 aa  55.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.221923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1325  hypothetical protein  29.56 
 
 		 351 aa  55.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.213882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0999  cell wall anchor domain-containing protein  30.85 
 
 		 224 aa  55.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000353845  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3646  putative lipoprotein  26.07 
 
 		 264 aa  51.6  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.499343  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2179  putative lipoprotein  26.07 
 
 		 253 aa  50.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.255362  normal  0.223351 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3890  hypothetical protein  33.62 
 
 		 260 aa  50.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3778  hypothetical protein  33.62 
 
 		 260 aa  50.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157644  normal  0.0998357 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1389  hypothetical protein  40.2 
 
 		 232 aa  50.1  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0507165 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05210  hypothetical protein  26.06 
 
 		 207 aa  50.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.193407  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3757  hypothetical protein  37.65 
 
 		 292 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0626654  normal  0.0846968 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>