26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3473 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3473  lipoprotein  100 
 
 
273 aa  518  1e-146  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0475  lipoprotein  75.8 
 
 
279 aa  288  8e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.786291  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0372  lipoprotein  64.08 
 
 
277 aa  247  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0220  lipoprotein  70.15 
 
 
277 aa  237  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3055  lipoprotein  66.84 
 
 
235 aa  235  7e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3257  lipoprotein  65.48 
 
 
235 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0735939  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4205  hypothetical protein  53.2 
 
 
276 aa  195  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.548465 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4635  hypothetical protein  42.46 
 
 
276 aa  170  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.616859  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4658  hypothetical protein  54.77 
 
 
269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3105  hypothetical protein  50.75 
 
 
280 aa  163  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.58027  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2642  hypothetical protein  34.44 
 
 
240 aa  102  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0107943  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1578  hypothetical protein  33.96 
 
 
240 aa  98.6  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000507242  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0999  cell wall anchor domain-containing protein  32.93 
 
 
224 aa  62.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000353845  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2144  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  36.17 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.891643  hitchhiker  0.000531775 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0598  hypothetical protein  33.89 
 
 
263 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2678  hypothetical protein  32.31 
 
 
455 aa  56.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176032  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2469  cell wall anchor domain-containing protein  32.98 
 
 
259 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2803  hypothetical protein  33.97 
 
 
715 aa  54.3  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.549688  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2340  cell wall anchor domain-containing protein  32.42 
 
 
259 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1389  hypothetical protein  30.37 
 
 
232 aa  48.9  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0507165 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1378  hypothetical protein  34.76 
 
 
273 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1325  hypothetical protein  30.73 
 
 
351 aa  45.8  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.213882  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002699  hypothetical protein  27.37 
 
 
442 aa  45.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174036  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0725  hypothetical protein  45.16 
 
 
423 aa  43.5  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2068  hypothetical protein  32.99 
 
 
317 aa  42.7  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270078  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03285  hypothetical protein  26.82 
 
 
452 aa  42.4  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>