19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3105 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3105  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  518  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.58027  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4205  hypothetical protein  50.62 
 
 		 276 aa  216  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.548465 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4635  hypothetical protein  46.61 
 
 		 276 aa  187  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.616859  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0475  lipoprotein  53.24 
 
 		 279 aa  182  7e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.786291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4658  hypothetical protein  53.43 
 
 		 269 aa  178  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0372  lipoprotein  48.35 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3257  lipoprotein  50.52 
 
 		 235 aa  169  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0735939  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3055  lipoprotein  52.08 
 
 		 235 aa  169  5e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3473  lipoprotein  49.76 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0220  lipoprotein  47 
 
 		 277 aa  160  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2642  hypothetical protein  32.42 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0107943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1578  hypothetical protein  31.13 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000507242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2469  cell wall anchor domain-containing protein  37.24 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2340  cell wall anchor domain-containing protein  36.84 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2144  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.99 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.891643  hitchhiker  0.000531775 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4116  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  36.67 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2573  hypothetical protein  42.59 
 
 		 217 aa  46.2  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2678  hypothetical protein  38.2 
 
 		 455 aa  43.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176032  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05210  hypothetical protein  27.08 
 
 		 207 aa  42.7  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.193407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>