70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0338 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0338  CHRD domain containing protein  100 
 
 		 154 aa  304  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2174  hypothetical protein  38.81 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.324144  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2111  hypothetical protein  38.81 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000509964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2354  hypothetical protein  38.81 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2332  hypothetical protein  38.81 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2427  hypothetical protein  38.81 
 
 		 132 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2096  hypothetical protein  37.31 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5370  hypothetical protein  34.11 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.847309  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5053  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4883  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5294  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000867603 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5438  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4998  CHRD domain-containing protein  33.33 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4898  hypothetical protein  34.11 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5315  hypothetical protein  34.11 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5634  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.946842  hitchhiker  0.0000000000653167 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5325  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3749  CHRD domain-containing protein  28.68 
 
 		 139 aa  67  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  29.55 
 
 		 479 aa  62.8  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  30.08 
 
 		 819 aa  62  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3037  CHRD domain-containing protein  30.53 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6077  CHRD domain-containing protein  29.3 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.563536 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2136  CHRD domain-containing protein  28.66 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.911321  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2774  CHRD domain-containing protein  28.66 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2748  CHRD domain-containing protein  28.66 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0538  CHRD domain-containing superfamily  29.68 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1716  CHRD  29.93 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.344065  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1308  CHRD  31.25 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.971052  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2054  CHRD domain-containing protein  28.39 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.332284  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0666  CHRD domain-containing protein  31.94 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0402  hypothetical protein  40 
 
 		 80 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2066  hypothetical protein  26.67 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0650  CHRD domain-containing protein  31.94 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.644603  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2381  CHRD domain-containing protein  31.94 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.740751  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2301  CHRD domain-containing protein  31.94 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.712267  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2778  CHRD domain-containing protein  31.94 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0826  hypothetical protein  31.94 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0170  hypothetical protein  31.94 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4549  CHRD domain-containing protein  28.12 
 
 		 862 aa  50.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3954  CHRD domain containing protein  31.43 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.689351  normal  0.0638434 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0551  CHRD domain-containing protein  29.27 
 
 		 144 aa  48.5  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0634  CHRD domain containing protein  29.56 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.231612  normal  0.156078 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1678  CHRD domain containing protein  30.71 
 
 		 221 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1194  hypothetical protein  27.69 
 
 		 531 aa  47  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2665  CHRD domain-containing protein  29.3 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0581  CHRD domain-containing protein  29.03 
 
 		 408 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0158  hypothetical protein  28.57 
 
 		 513 aa  46.2  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0541  CHRD domain containing protein  26.19 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.9695  normal  0.973428 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1174  CHRD domain containing protein  32.94 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0629286  normal  0.936237 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1080  CHRD  32 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.183824 
 
 
-
 
NC_004310  BR0022  hypothetical protein  26.92 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0352588  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0939  CHRD domain-containing protein  28.43 
 
 		 167 aa  45.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3258  CHRD domain containing protein  36.59 
 
 		 411 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335818  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0019  hypothetical protein  26.28 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.229007  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2374  CHRD domain containing protein  33.8 
 
 		 174 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000109429  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2218  CHRD domain containing protein  28.12 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2798  CHRD domain-containing protein  30 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.885551  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2824  CHRD domain-containing protein  30.77 
 
 		 407 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.227844  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3145  CHRD  36.59 
 
 		 413 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5363  CHRD domain containing protein  28.8 
 
 		 282 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.974056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0359  CHRD domain-containing protein  26.25 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1290  CHRD  25 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.200605  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4065  hypothetical protein  28.3 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3444  CHRD domain containing protein  26.15 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576852  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3336  CHRD domain containing protein  37.04 
 
 		 412 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6737  CHRD domain-containing protein  26.75 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3461  CHRD domain containing protein  26.67 
 
 		 211 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.664498 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2087  CHRD domain containing protein  34.26 
 
 		 729 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.090076 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1896  CHRD domain-containing protein  25 
 
 		 156 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3001  chordin  26.36 
 
 		 171 aa  40  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410033 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>