56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2226 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2226  CHRD  100 
 
 		 152 aa  306  9e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.156145  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3001  chordin  65.32 
 
 		 171 aa  175  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1896  CHRD domain-containing protein  62.69 
 
 		 156 aa  153  7e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2218  CHRD domain containing protein  51.35 
 
 		 149 aa  127  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1308  CHRD  56.48 
 
 		 140 aa  124  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.971052  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1080  CHRD  50.93 
 
 		 141 aa  121  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.183824 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0538  CHRD domain-containing superfamily  41.73 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2381  CHRD domain-containing protein  41.43 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.740751  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2301  CHRD domain-containing protein  41.43 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.712267  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2778  CHRD domain-containing protein  41.43 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0826  hypothetical protein  41.43 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0666  CHRD domain-containing protein  41.43 
 
 		 144 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0650  CHRD domain-containing protein  41.43 
 
 		 144 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.644603  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0359  CHRD domain-containing protein  40 
 
 		 144 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6077  CHRD domain-containing protein  45.38 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.563536 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0551  CHRD domain-containing protein  47.37 
 
 		 144 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3444  CHRD domain containing protein  51.33 
 
 		 147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576852  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2665  CHRD domain-containing protein  50.96 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0634  CHRD domain containing protein  50 
 
 		 144 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.231612  normal  0.156078 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2798  CHRD domain-containing protein  50.96 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.885551  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0170  hypothetical protein  43.75 
 
 		 134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2774  CHRD domain-containing protein  45.38 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2748  CHRD domain-containing protein  45.38 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2136  CHRD domain-containing protein  45.38 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.911321  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4065  hypothetical protein  48.08 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6737  CHRD domain-containing protein  46.62 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2966  hypothetical protein  42.19 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0019  hypothetical protein  42.14 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.229007  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0444  CHRD domain-containing protein  49.56 
 
 		 151 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182512  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0022  hypothetical protein  41.43 
 
 		 144 aa  90.1  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0352588  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1174  CHRD domain containing protein  45.1 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0629286  normal  0.936237 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4549  CHRD domain-containing protein  41.96 
 
 		 862 aa  82.8  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2082  hypothetical protein  40 
 
 		 199 aa  80.1  0.000000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5363  CHRD domain containing protein  37.72 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.974056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3037  CHRD domain-containing protein  41.59 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2480  CHRD domain-containing protein  36.63 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0119714  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2026  CHRD domain containing protein  34.53 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5666  CHRD domain containing protein  31.67 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  32.03 
 
 		 819 aa  63.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0158  hypothetical protein  33.04 
 
 		 513 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2096  hypothetical protein  30.77 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2332  hypothetical protein  30 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2427  hypothetical protein  30 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2354  hypothetical protein  30 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2111  hypothetical protein  30 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000509964  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2174  hypothetical protein  30 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.324144  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37354  predicted protein  38.96 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0263858  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  37 
 
 		 479 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2066  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0581  CHRD domain-containing protein  35.29 
 
 		 408 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1716  CHRD  31.4 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.344065  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0849  hypothetical protein  29.93 
 
 		 213 aa  45.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.873186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0541  CHRD domain containing protein  26.67 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.9695  normal  0.973428 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3258  CHRD domain containing protein  33.62 
 
 		 411 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335818  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3336  CHRD domain containing protein  31.93 
 
 		 412 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3145  CHRD  33.63 
 
 		 413 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>