70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1896 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1896  CHRD domain-containing protein  100 
 
 		 156 aa  310  3.9999999999999997e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3001  chordin  71.15 
 
 		 171 aa  231  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2226  CHRD  62.04 
 
 		 152 aa  169  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.156145  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2218  CHRD domain containing protein  61.49 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1308  CHRD  56.76 
 
 		 140 aa  152  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.971052  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1080  CHRD  54.05 
 
 		 141 aa  150  8e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.183824 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6077  CHRD domain-containing protein  46.62 
 
 		 144 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.563536 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2798  CHRD domain-containing protein  52.1 
 
 		 144 aa  130  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.885551  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2665  CHRD domain-containing protein  52.1 
 
 		 144 aa  130  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0551  CHRD domain-containing protein  54.78 
 
 		 144 aa  130  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6737  CHRD domain-containing protein  47.92 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2136  CHRD domain-containing protein  46.62 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.911321  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2748  CHRD domain-containing protein  46.62 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2774  CHRD domain-containing protein  46.62 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0634  CHRD domain containing protein  53.39 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.231612  normal  0.156078 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0538  CHRD domain-containing superfamily  43.75 
 
 		 144 aa  125  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0359  CHRD domain-containing protein  50 
 
 		 144 aa  125  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3444  CHRD domain containing protein  55.56 
 
 		 147 aa  124  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576852  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4065  hypothetical protein  51.28 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2381  CHRD domain-containing protein  43.14 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.740751  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2301  CHRD domain-containing protein  43.14 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.712267  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2778  CHRD domain-containing protein  43.14 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0666  CHRD domain-containing protein  43.14 
 
 		 144 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0650  CHRD domain-containing protein  43.14 
 
 		 144 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.644603  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0170  hypothetical protein  50.43 
 
 		 134 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0826  hypothetical protein  50.43 
 
 		 144 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1174  CHRD domain containing protein  50.46 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0629286  normal  0.936237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0444  CHRD domain-containing protein  46.05 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182512  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2966  hypothetical protein  44.35 
 
 		 173 aa  99.8  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0019  hypothetical protein  44.26 
 
 		 144 aa  96.7  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.229007  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0022  hypothetical protein  43.44 
 
 		 144 aa  94.7  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0352588  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4549  CHRD domain-containing protein  46.36 
 
 		 862 aa  89.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5363  CHRD domain containing protein  37.29 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.974056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2082  hypothetical protein  36.89 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5666  CHRD domain containing protein  34.96 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3037  CHRD domain-containing protein  40.87 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2480  CHRD domain-containing protein  38.83 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0119714  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0158  hypothetical protein  38.89 
 
 		 513 aa  73.9  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2026  CHRD domain containing protein  38.33 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2096  hypothetical protein  34.65 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2111  hypothetical protein  34.65 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000509964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2354  hypothetical protein  34.65 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2174  hypothetical protein  34.65 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.324144  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2332  hypothetical protein  34.65 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0581  CHRD domain-containing protein  40.17 
 
 		 408 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2427  hypothetical protein  33.07 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37354  predicted protein  30.67 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0263858  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  32.1 
 
 		 819 aa  57.8  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2824  CHRD domain-containing protein  31.2 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.227844  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  41.18 
 
 		 479 aa  53.9  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0849  hypothetical protein  31.76 
 
 		 213 aa  53.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.873186 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3145  CHRD  38.18 
 
 		 413 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3258  CHRD domain containing protein  37.17 
 
 		 411 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335818  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0541  CHRD domain containing protein  27.91 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.9695  normal  0.973428 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1290  CHRD  33.33 
 
 		 206 aa  50.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.200605  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3336  CHRD domain containing protein  37.84 
 
 		 412 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1716  CHRD  29.69 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.344065  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2578  hypothetical protein  27.68 
 
 		 201 aa  45.1  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5053  hypothetical protein  23.44 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5438  hypothetical protein  23.44 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5294  hypothetical protein  23.44 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000867603 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4998  CHRD domain-containing protein  25 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3461  CHRD domain containing protein  28.29 
 
 		 211 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.664498 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4883  hypothetical protein  23.44 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2066  hypothetical protein  31.03 
 
 		 150 aa  44.3  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4898  hypothetical protein  21.71 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5634  hypothetical protein  22.66 
 
 		 137 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.946842  hitchhiker  0.0000000000653167 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5325  hypothetical protein  22.66 
 
 		 137 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5370  hypothetical protein  21.71 
 
 		 137 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.847309  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5315  hypothetical protein  20.93 
 
 		 137 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>