72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2082 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2082  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  404  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114643  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2966  hypothetical protein  39.74 
 
 		 173 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4549  CHRD domain-containing protein  45.95 
 
 		 862 aa  92.4  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1080  CHRD  41.73 
 
 		 141 aa  92  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.183824 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0019  hypothetical protein  37.59 
 
 		 144 aa  86.7  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.229007  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3001  chordin  43.75 
 
 		 171 aa  86.7  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2381  CHRD domain-containing protein  36.62 
 
 		 144 aa  85.1  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.740751  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0666  CHRD domain-containing protein  36.62 
 
 		 144 aa  85.1  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0650  CHRD domain-containing protein  36.62 
 
 		 144 aa  85.1  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.644603  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2301  CHRD domain-containing protein  36.62 
 
 		 144 aa  85.1  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.712267  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2778  CHRD domain-containing protein  36.62 
 
 		 144 aa  85.1  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0826  hypothetical protein  36.62 
 
 		 144 aa  84.7  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0022  hypothetical protein  36.88 
 
 		 144 aa  84.7  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0352588  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6737  CHRD domain-containing protein  41.22 
 
 		 147 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1308  CHRD  42.06 
 
 		 140 aa  84.7  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.971052  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0170  hypothetical protein  38.06 
 
 		 134 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0551  CHRD domain-containing protein  43.56 
 
 		 144 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0359  CHRD domain-containing protein  34.75 
 
 		 144 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0538  CHRD domain-containing superfamily  37.12 
 
 		 144 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3037  CHRD domain-containing protein  42.34 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2226  CHRD  40 
 
 		 152 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.156145  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4065  hypothetical protein  43.3 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2774  CHRD domain-containing protein  41.58 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2748  CHRD domain-containing protein  41.58 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2136  CHRD domain-containing protein  41.58 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.911321  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0634  CHRD domain containing protein  42.27 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.231612  normal  0.156078 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6077  CHRD domain-containing protein  37.62 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.563536 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2665  CHRD domain-containing protein  37.62 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2798  CHRD domain-containing protein  37.62 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.885551  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3444  CHRD domain containing protein  41 
 
 		 147 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576852  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37354  predicted protein  41.67 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0263858  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1174  CHRD domain containing protein  41.07 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0629286  normal  0.936237 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1290  CHRD  32.24 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.200605  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0444  CHRD domain-containing protein  35.25 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1896  CHRD domain-containing protein  36.89 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2218  CHRD domain containing protein  43.96 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5363  CHRD domain containing protein  29.63 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.974056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2480  CHRD domain-containing protein  31.78 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0119714  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0849  hypothetical protein  34.19 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.873186 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2578  hypothetical protein  32.32 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  28.75 
 
 		 479 aa  49.3  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1803  hypothetical protein  75 
 
 		 266 aa  48.1  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2327  hypothetical protein  49.02 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0541  CHRD domain containing protein  29.52 
 
 		 137 aa  47.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.9695  normal  0.973428 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2339  hypothetical protein  73.08 
 
 		 297 aa  46.6  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0581  CHRD domain-containing protein  34.95 
 
 		 408 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0451  alkaline phosphatase  65.71 
 
 		 497 aa  47  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000822257  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2338  hypothetical protein  65.38 
 
 		 160 aa  45.8  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2328  hypothetical protein  79.17 
 
 		 181 aa  45.8  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1249  hypothetical protein  62.96 
 
 		 214 aa  45.8  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.232611  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2728  phosphatase-like  48.94 
 
 		 462 aa  45.8  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.427102  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2427  hypothetical protein  76 
 
 		 231 aa  45.1  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0532981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  31.53 
 
 		 819 aa  44.3  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  54.84 
 
 		 419 aa  44.3  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2026  CHRD domain containing protein  36.36 
 
 		 151 aa  42.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2326  hypothetical protein  65.38 
 
 		 139 aa  43.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1261  hypothetical protein  68 
 
 		 269 aa  43.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1090  hypothetical protein  64 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2325  hypothetical protein  64 
 
 		 150 aa  42.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1390  hypothetical protein  35.14 
 
 		 379 aa  42.7  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000676729  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1067  hypothetical protein  64 
 
 		 202 aa  42.4  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2824  CHRD domain-containing protein  31.85 
 
 		 407 aa  42.4  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.227844  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1203  hypothetical protein  66.67 
 
 		 242 aa  42.4  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.743996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2652  hypothetical protein  30 
 
 		 326 aa  42.4  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1677  hypothetical protein  62.5 
 
 		 288 aa  42.4  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1593  hypothetical protein  62.5 
 
 		 188 aa  42  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157492 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1259  hypothetical protein  56.67 
 
 		 208 aa  42  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3336  CHRD domain containing protein  36.04 
 
 		 412 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2324  hypothetical protein  64 
 
 		 201 aa  41.6  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5666  CHRD domain containing protein  35.85 
 
 		 161 aa  41.6  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3145  CHRD  36.04 
 
 		 413 aa  41.2  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2651  hypothetical protein  47.92 
 
 		 433 aa  41.2  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>