37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1803 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_1803  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  518  1e-146  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0352  hypothetical protein  62.22 
 
 
285 aa  53.9  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.972359  normal  0.0160007 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2328  hypothetical protein  92 
 
 
181 aa  51.6  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1800  hypothetical protein  49.09 
 
 
209 aa  51.2  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.444481  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2652  hypothetical protein  57.58 
 
 
326 aa  50.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1249  hypothetical protein  76.92 
 
 
214 aa  50.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.232611  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0506  hypothetical protein  76.92 
 
 
203 aa  49.7  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40604  normal  0.281124 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1713  hypothetical protein  80 
 
 
270 aa  49.7  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2338  hypothetical protein  45.28 
 
 
160 aa  49.7  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2427  hypothetical protein  80.77 
 
 
231 aa  49.3  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0532981  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2327  hypothetical protein  71.43 
 
 
206 aa  48.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2082  hypothetical protein  75 
 
 
199 aa  48.1  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114643  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0451  alkaline phosphatase  84 
 
 
497 aa  48.5  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000822257  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1090  hypothetical protein  71.43 
 
 
223 aa  47.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2325  hypothetical protein  79.17 
 
 
150 aa  47.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2324  hypothetical protein  80 
 
 
201 aa  47.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2339  hypothetical protein  66.67 
 
 
297 aa  47  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0262  hypothetical protein  66.67 
 
 
206 aa  45.8  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000101412  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1593  hypothetical protein  46.51 
 
 
188 aa  45.8  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157492 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1067  hypothetical protein  58.82 
 
 
202 aa  45.8  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0505  hypothetical protein  90.91 
 
 
210 aa  45.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.269231 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2253  hypothetical protein  36.56 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000307297  unclonable  0.000000143416 
 
 
 
NC_010524  Lcho_2326  hypothetical protein  67.86 
 
 
139 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0709  hypothetical protein  52.63 
 
 
261 aa  44.7  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0163058  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2031  hypothetical protein  42.19 
 
 
179 aa  45.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0465  carbonate dehydratase  65.52 
 
 
288 aa  45.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2252  hypothetical protein  75 
 
 
233 aa  45.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1804  hypothetical protein  79.17 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.206043  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1122  hypothetical protein  71.43 
 
 
243 aa  44.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.182832 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2728  phosphatase-like  76 
 
 
462 aa  44.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.427102  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1677  hypothetical protein  65.38 
 
 
288 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0167  hypothetical protein  76 
 
 
239 aa  43.9  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1718  hypothetical protein  64.29 
 
 
226 aa  43.1  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000144169  unclonable  0.000000229382 
 
 
 
NC_007947  Mfla_1203  hypothetical protein  51.52 
 
 
242 aa  42.7  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.743996  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0373  hypothetical protein  28.57 
 
 
279 aa  42.4  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00337084  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1190  hypothetical protein  75 
 
 
268 aa  42.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100853  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2005  hypothetical protein  66.67 
 
 
148 aa  42  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00997836  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>