37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0352 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0352  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  558  1e-158  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.972359  normal  0.0160007 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2578  hypothetical protein  30.52 
 
 
294 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2326  hypothetical protein  48.53 
 
 
139 aa  63.2  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1803  hypothetical protein  62.22 
 
 
266 aa  53.9  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2325  hypothetical protein  56.82 
 
 
150 aa  53.5  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0088  hypothetical protein  38.14 
 
 
211 aa  52  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1800  hypothetical protein  81.48 
 
 
209 aa  50.8  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.444481  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1249  hypothetical protein  59.52 
 
 
214 aa  51.6  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.232611  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2427  hypothetical protein  70 
 
 
231 aa  49.3  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0532981  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1713  hypothetical protein  70.37 
 
 
270 aa  48.9  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2338  hypothetical protein  62.5 
 
 
160 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2328  hypothetical protein  71.43 
 
 
181 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1122  hypothetical protein  75.86 
 
 
243 aa  47.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.182832 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2327  hypothetical protein  40.51 
 
 
206 aa  47.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0506  hypothetical protein  65.52 
 
 
203 aa  47.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40604  normal  0.281124 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1718  hypothetical protein  46.38 
 
 
226 aa  47  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000144169  unclonable  0.000000229382 
 
 
 
NC_007947  Mfla_2096  hypothetical protein  70.37 
 
 
259 aa  46.6  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0004226  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1132  hypothetical protein  68.57 
 
 
188 aa  46.2  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566375  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2324  hypothetical protein  66.67 
 
 
201 aa  46.2  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0451  alkaline phosphatase  70.37 
 
 
497 aa  45.8  0.0009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000822257  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1090  hypothetical protein  69.23 
 
 
223 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1593  hypothetical protein  28.77 
 
 
188 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157492 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1598  hypothetical protein  74.07 
 
 
263 aa  45.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000163018  unclonable  0.000000204973 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0709  hypothetical protein  70.37 
 
 
261 aa  45.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0163058  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0167  hypothetical protein  67.86 
 
 
239 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1804  hypothetical protein  65.62 
 
 
227 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.206043  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1844  hypothetical protein  50 
 
 
178 aa  43.9  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000118291  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2339  hypothetical protein  52.5 
 
 
297 aa  43.9  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1203  hypothetical protein  60.71 
 
 
242 aa  43.5  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.743996  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0471  hypothetical protein  37.23 
 
 
241 aa  43.5  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.562548  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1594  hypothetical protein  47.5 
 
 
182 aa  43.1  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164721 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2652  hypothetical protein  59.26 
 
 
326 aa  43.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2731  hypothetical protein  64.29 
 
 
217 aa  43.1  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000468219  unclonable  0.000000144909 
 
 
 
NC_010524  Lcho_1067  hypothetical protein  59.26 
 
 
202 aa  42.7  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2253  hypothetical protein  33.78 
 
 
248 aa  42.7  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000307297  unclonable  0.000000143416 
 
 
 
NC_007614  Nmul_A0262  hypothetical protein  33.75 
 
 
206 aa  42.7  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000101412  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0505  hypothetical protein  75 
 
 
210 aa  42.4  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.269231 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>