57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0465 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0465  carbonate dehydratase  100 
 
 
288 aa  586  1e-166  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0461  carbonate dehydratase  56.07 
 
 
313 aa  334  9e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.454779  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0862  Carbonate dehydratase  38.57 
 
 
252 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3698  carbonate dehydratase  35.81 
 
 
246 aa  133  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0578  Carbonate dehydratase  33.98 
 
 
246 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000218816  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05086  carbonic anhydrase  36.84 
 
 
241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0238  Carbonate dehydratase  36.67 
 
 
244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0242  carbonic anhydrase  37.75 
 
 
244 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2167  carbonic anhydrase  39.22 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  0.0204044 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1725  carbonate dehydratase  40 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0973  twin-arginine translocation pathway signal  41.11 
 
 
264 aa  126  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0132613  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1056  carbonic anhydrase precursor  37.25 
 
 
235 aa  125  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0785  carbonate dehydratase  37.62 
 
 
252 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.853738 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000779  carbonic anhydrase  35.1 
 
 
239 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0512  carbonate dehydratase  38.42 
 
 
370 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0845304 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0030  carbonate dehydratase  36.99 
 
 
249 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.123729  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0791  carbonic anhydrase (carbonate dehydratase)  35.75 
 
 
253 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00959218 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2989  carbonic anhydrase  46.05 
 
 
267 aa  123  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0923119  normal  0.0164403 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4625  carbonate dehydratase  37.93 
 
 
263 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1236  carbonate dehydratase  34.47 
 
 
252 aa  122  7e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0359  carbonate dehydratase  35.19 
 
 
261 aa  122  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001220  carbonic anhydrase  35.47 
 
 
239 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2228  carbonate dehydratase  34.13 
 
 
249 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103862  normal  0.0736818 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1545  carbonate dehydratase  34.76 
 
 
315 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4422  carbonate dehydratase  35.12 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000131001  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3922  carbonic anhydrase  36.27 
 
 
481 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2952  carbonic anhydrase  34.84 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3166  Carbonate dehydratase  34.84 
 
 
258 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3753  carbonate dehydratase  36.95 
 
 
247 aa  118  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.405965 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1480  carbonate dehydratase  32.26 
 
 
243 aa  117  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.551291  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1132  carbonate dehydratase  33.95 
 
 
315 aa  117  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0536643  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0957  carbonic anhydrase  35.4 
 
 
239 aa  115  7.999999999999999e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000379553  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2853  Carbonate dehydratase  37.56 
 
 
256 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6140  carbonate dehydratase  34.76 
 
 
249 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0412  carbonate dehydratase  32.18 
 
 
245 aa  108  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.289569  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1623  carbonate dehydratase  33.99 
 
 
260 aa  108  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.108913  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2660  carbonate dehydratase  33.65 
 
 
255 aa  106  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0379533  normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0758  carbonate dehydratase  36.63 
 
 
250 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.415587  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4235  carbonate dehydratase  33.82 
 
 
259 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355304  normal  0.29806 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4960  carbonate dehydratase  33.15 
 
 
259 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3200  carbonate dehydratase  33.15 
 
 
259 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0238  carbonic anhydrase  36 
 
 
213 aa  100  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3535  Carbonate dehydratase  36.42 
 
 
440 aa  99  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169565 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1004  carbonic anhydrase  37.82 
 
 
436 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0975  Carbonate dehydratase  37.82 
 
 
436 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2073  carbonic anhydrase  32.89 
 
 
207 aa  90.5  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.495704  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1388  carbonate dehydratase  38.71 
 
 
237 aa  85.1  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000301506  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1514  conserved hypothetical protein, putative carbonic anhydrase  26.82 
 
 
246 aa  84  0.000000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3462  carbonic anhydrase  28.57 
 
 
614 aa  79  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1080  carbonic anhydrase  34.03 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.759573  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2138  carbonic anhydrase  25.74 
 
 
191 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00878397  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1249  hypothetical protein  73.08 
 
 
214 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.232611  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1803  hypothetical protein  65.52 
 
 
266 aa  45.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0451  alkaline phosphatase  44.83 
 
 
497 aa  43.5  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000822257  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2328  hypothetical protein  72 
 
 
181 aa  43.5  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2427  hypothetical protein  62.96 
 
 
231 aa  43.1  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0532981  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2338  hypothetical protein  42.86 
 
 
160 aa  43.1  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>